生信自学笔记（一）：概述

想涉猎生物信息学已经很久了，只是苦于平时作业繁重，没有连续的时间坐下来好好学习。好不容易捱到暑假，是时候补一波知识了。

自学教材：《生物信息学》（樊龙江主编）

当初在图书馆找教材，找了好几种，出版社不同，年代不同，装帧风格也非常不一样。迷茫的我就去请教了研究生师姐，然鹅她说课本这种东西都是大同小异的，于是我果断选了颜值最高同时也是出版最新的一本书 (2015 应该算是很新的了)。现在想想，可能还有一个因素是因为这是浙大的老师写的，虽然因为自己水平菜没去成，但所谓 “虽不能至，心向往之”，或多或少还是有一丝执念吧。

课本的第一部分就是对这门学科的介绍，写得很清晰，看起来也颇有意思，浓缩一下，大概就是这么几句话：

• 分子生物学研究的飞跃带来了生物信息的剧烈膨胀，并形成了巨量的生物信息库，促成了生物信息学这一全新研究领域的诞生。
• 生信的研究对象即生物信息包含有多种类型，如分子序列数据、蛋白质二级结构和三维结构。它们直接构成了初级数据库。而根据这些数据建立起来的功能区、二级结构、疏水位点等等，构成了所谓的二级数据库。
• 生信的主要内容可以概括为：新算法和统计学方法研究 + 各类数据的分析和解释 + 研制有效利用和管理数据的新工具。
• 生信的具体研究领域有：序列联配、基因预测、基因组拼接、药物设计和筛选、蛋白质结构预测、基因表达和蛋白质互作预测、全基因组连锁和进化分析等。
• 生信研究的基本思路是和生物学的基本思路一脉相承的，即先提出假设，再去检验假设是否正确，大概和统计学里面的假设检验有异曲同工之妙。

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