5、蛋白质 - 碳水化合物相互作用的研究探索

蛋白质 - 碳水化合物相互作用的研究探索

1. 组织工程中的碳水化合物应用

在组织工程领域，碳水化合物的作用愈发受到关注。研究人员通过化学合成方法制备了一系列炔基功能化单糖，以此来验证含叠氮基的人源自组装纤维（hSAF）衍生物系统与碳水化合物的修饰情况，确保水凝胶的结构和性能不会受到不利影响。

许多与细胞发育相关的碳水化合物对神经细胞类型有影响。由于 hSAF 的硬度与神经组织相近，因此主要针对这些碳水化合物进行研究。除了半乳糖（Gal）和唾液酸半乳糖（SGal）等单糖外，还利用化学酶法合成了一系列具有已知生物反应的寡糖，其中包括可能对神经组织工程有用的 β - 半乳糖苷，如 N - 乙酰乳糖胺（LacNAc）和路易斯 X 抗原（LeX）。

2. 蛋白质 - 碳水化合物相互作用的研究

2.1 确定蛋白质结构中的碳水化合物

研究蛋白质 - 碳水化合物相互作用（PCIs）时，RCSB PDB 数据库是重要的数据来源。但分析这些相互作用面临诸多挑战，因为碳水化合物结构复杂，且 PDB 中记录的碳水化合物结构存在诸多问题。
- 结构标签问题 ：虽然 PDB 格式的结构中有不同碳水化合物的标准化残基标签，但这些标签不一致且使用不规范。例如，单个单糖有标签，但不能总是区分异头体；一些取代单糖单元有单独标签，而另一些则使用母体单糖标签；在某些情况下，整个寡糖会被赋予一个标签来代替单个单糖的标签。
- 连接性处理问题 ：PDB 中寡糖和聚糖的连接性处理不一致。由于存在分支和同一寡糖的多个实例，其连接性比蛋白质更复杂。在一些结构中，碳水化合物配体与相互作用的蛋白质链一起标