单细胞pipeline
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Seurat
DerekRusso
Clean code and artistic research.
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【scRNAtoolVis】单细胞分析基本图形的美化
基本图形的快速成型原创 2022-12-06 16:44:22 · 3472 阅读 · 1 评论 -
【plot1cell】大牛亲传可视化
Humphrey亲传可视化原创 2022-12-05 16:52:30 · 1181 阅读 · 0 评论 -
【tricycle】Transferable Representation and Inference of Cell Cycle
细胞周期推断原创 2022-11-23 10:46:55 · 294 阅读 · 0 评论 -
【hdWGCNA】high dimensional WGCNA analysis for single cell datasets
high dimensional WGCNA analysis for single cell datasets (multiple conditions and samples avaliable)原创 2022-10-11 10:49:07 · 1152 阅读 · 0 评论 -
【clustermole】cell type marker database and enrichment
clustermole整合了数个数据库的cell type marker，也可以通过重叠分析、富集分析帮助细胞类型注释。原创 2022-09-10 10:15:10 · 596 阅读 · 0 评论 -
Harmony integration in Seurat V3 pipeline
Harmony整合多样本单细胞数据，具有占用内存小、速度快、结果佳的优势，这在此时整合方法学普遍计算压力较大的情况下尤为珍贵。原创 2022-07-19 22:39:01 · 647 阅读 · 1 评论 -
【ROGUE】assessing the purity of clusters
GitHub & BitBucket HTML Preview原创 2022-05-25 09:13:28 · 232 阅读 · 0 评论 -
【DoubletFinder】predicts doublets in single-cell RNA sequencing data
DF原创 2022-04-29 09:46:59 · 591 阅读 · 0 评论 -
【Scillus】single cell illustration from seurat
Scillus是Seurat体系中的wrapper包，增强了其分析与作图功能。原创 2022-04-28 09:32:37 · 386 阅读 · 0 评论