- 博客(12)
- 收藏
- 关注
原创 单细胞分析报错:err: name incorrect while evaluating path within network system module - Scheme is ‘https‘
报错:prefetch SRR10340997 -o `pwd` && echo "** SRR****.sra done **"网上方案:查看sra-tools版本是否最新版(可以重新安装最新版或建立新的环境安装最新,建议删除。
2025-01-14 23:40:51
236
原创 单细胞分析报错-Error in ..subscript.2ary(x, l[[1L]], l[[2L]], drop = drop[1L]) : x[i,j] too dense for [C
用的全部基因,没找高变基因。
2024-08-07 10:19:27
550
2
原创 单细胞分析报错-不能用所有基因来scale数据
VlnPlot(object =pbmc_harmony196, features = "PC_1", pt.size = 0, group.by = "dataset",raster=FALSE) #PCA聚类-dataset分组-Vln。VlnPlot(object =pbmc_harmony196, features = "PC_1", pt.size = 0, group.by = "dataset",raster=FALSE) #PCA聚类-dataset分组-Vln。
2024-06-19 10:13:33
1124
1
原创 单细胞分析报错:Error in marker.test[[i]] : subscript out of bounds
harmony整合后,寻找cluster marker时,在cluster12开始报错。
2024-01-28 11:48:38
344
原创 单细胞分析报错:Error: Please run UpdateSeuratObject on your object
读取rds文件后,GSE161918不是seurat对像?
2023-12-17 23:19:32
1312
1
原创 unable to coerce from TsparseMatrix to [CR]sparseMatrixwhen length of ‘i‘ slot exceeds 2^31-1
单细胞分析整合achors时报错:为什么?
2023-08-11 10:22:51
579
5
原创 服务器装R(非root权限)
conda create -n renv # 创建环境。conda deactivate # 退出环境。conda activate renv # 激活环境。# 安装R 4.1.4 版本。# 在Linux环境下。
2023-07-23 13:45:17
279
原创 python使用pandas打不开excel文件
使用openpyxl解决“Excel xlsx file; not supported“问题。
2022-07-11 12:31:40
1095
原创 mac使用wxPython时无法打开界面
我用的jupyter notebook,使用wxPython进行GUI开发时遇到了上述问题,目前查到的解决方案:1.使用conda环境时(1)首先需要安装python.app 打开虚拟环境:conda activate 名称 终端输入命令行:conda install -c anaconda python.app 中间需要回车确认一次(2)然后启用pythonw 终端输入pythonw(3)完成...
2022-05-26 11:57:25
255
1
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人