Seurat数据指控中有cell cycle scoring,并在标准化环节可以去除这种影响。不过我一般不这么做,而且seurat cell cycle本质上是基于打分,结果辩证看待。
tricycle原理是向预先注释好的数据集投射,结果在跨平台、物种、器官中都有很好的迁移性。使用起来非常轻量,本质上就两句命令。
tricycle: Transferable Representation and Inference of Cell Cycle
本文探讨了Seurat中的cellcyclescoring功能及其在标准化过程中的应用, 并对比了Tricycle方法在跨平台、物种及器官的数据迁移优势。介绍了两种方法的基本原理和技术特点。
Seurat数据指控中有cell cycle scoring,并在标准化环节可以去除这种影响。不过我一般不这么做,而且seurat cell cycle本质上是基于打分,结果辩证看待。
tricycle原理是向预先注释好的数据集投射,结果在跨平台、物种、器官中都有很好的迁移性。使用起来非常轻量,本质上就两句命令。
tricycle: Transferable Representation and Inference of Cell Cycle

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