人与小鼠基因名转换

借助homologene处理

install.packages('homologene', lib="/Software/Binning-software/r.package")
.libPaths("/Software/Binning-software/r.package")
library(homologene)
gene <- read.table("protein_gene.txt", header=F) ##读取基因名表
genelist <- gene$V1

#使用homologene函进行转换
#@genelist是要转换的基因列表
#@inTax是输入的基因列表所属的物种号，10090是小鼠
#@outTax是要转换成的物种号，9606是人
tran_data <- homologene(genelist, inTax = 9606, outTax = 10090)

 

参考简书：

快速实现人和小鼠之间的同源基因转换 - 简书