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RSS订阅原创 在线绘制扇形二分类混淆矩阵
做完一个分类模型，在整理结果时，往往需要先看准确率，同时也需要明确模型把多少阳性样本漏判成了阴性，又把多少阴性样本误报成了阳性。这就是混淆矩阵的用武之地。
2026-10-22 16:28:03
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原创 微生信MCP：一个在线科研绘图AI 智能体MCP
微生信（Weishengxin）是提供300+生命科学绘图与分析工具的云端平台，支持通过MCP协议实现0代码科研绘图。用户仅需传入TSV数据与参数，即可调用火山图、热图、生存曲线等期刊级图表，输出PNG/PDF/SVG/TIFF格式。当前开放6个核心工具，涵盖模块查询、格式解析、绘图提交与结果获取，支持公共API Key免费使用免费模块。平台已服务41万用户，累计完成600万次任务，成果可被论文引用，适合AI客户端快速集成真实可用的科研作图能力。
2026-10-22 14:03:31
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原创 用 aPEAR R包聚类整理 GSEA 结果并进行网络图可视化
GSEA结果中经常出现一批名称不同但共享核心基因的通路。aPEAR先按通路相似性聚类，再用网络图展示，可以把冗长的结果表整理成几个功能模块。
2026-10-14 17:01:12
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原创 SCI 论文图表进阶：数值代替点的多组折线图，让趋势一目了然
在科研论文中，多组折线图是展示时间序列或分组趋势的标配。但传统的小圆点 marker 在数据密集时容易重叠，读者的视线在 legend 和曲线之间来回跳跃。如果能用数值直接标注在折线上——既保留趋势走向，又精确呈现每个节点的数值——信息密度和可读性将大大提升。
2026-10-14 12:09:00
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原创 《Nature Genetics》树图实操：五步把基因和功能分类缩进一张图
一组基因对应多个功能类别时，表格可以保留完整信息，却不方便比较各类别的大小。树图把类别、数量和基因名称放进同一张图，适合用来概览结果。
2026-10-13 11:42:48
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原创 一图看懂全基因组分布：染色体位置与分类统计联合展示
在全基因组尺度展示位点或区域时，我们通常既想知道“变化发生在哪里”，也想比较“不同类型在每条染色体上占多少”。如果把这两类信息拆成两张图，读者需要来回对照；而“染色体位置 + 统计柱状图”可以在同一画面中完成整合：右侧按照染色体长度标注事件的基因组位置，左侧同步汇总各类型在每条染色体上的比例或数量。这样既保留空间定位信息，也能快速比较染色体之间的分布差异，适用于突变位点、差异甲基化区域以及其他带有染色体坐标的分类数据。
2026-09-29 16:54:27
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原创 Nature Genetics同款弦图：从数据准备到参数复用
当一组表型同时关联多个基因时，表格可以列清楚配对关系，却不容易让读者快速看出哪些节点连接较多、不同类别如何分布。弦图把两类实体排在圆周两侧，用弦表示对应关系，并按节点的类别着色，简洁清晰。适合展示表型与基因、GO term 与基因、细胞类型与 marker 基因等两类实体间的关系。
2026-09-29 16:43:50
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原创 从 Barcode Rank Plot 到细胞条形码过滤的原理与 R 实操
raw 矩阵（图上蓝色线+灰色线）保存的是所有检测到的有效 barcode，其中绝大多数并不对应完整细胞。只有 raw 时，应先做 cell calling，生成候选细胞矩阵（图上蓝色线），再进入 Seurat 或 Scanpy。
2026-09-24 15:55:15
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原创 微生信同心圆网络图绘制与参数设置教程
同心圆网络图将节点按预先定义的类别或层级排列在多个同心圆上，并用连线表示节点之间的已知或推定关系。该布局适合同时呈现分层结构和连接关系，可用于 PPI、miRNA-TF-mRNA、circRNA-miRNA-mRNA 等网络的可视化。
2026-09-24 15:24:35
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原创 把基因与化合物“点亮”在 KEGG 通路图上：pathview 在线绘图教程
只需准备基因或化合物的定量数据，即可将表达变化、代谢差异直接映射到 KEGG Pathway Map。无需安装 R 包，也能快速获得一张关系清晰、颜色直观的通路图，帮助你从复杂数据中锁定关键基因、酶与代谢物。
2026-09-02 15:23:26
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原创 桑基-气泡组合图：在功能分类框架下展示多组富集结果
可将“桑基图”与“气泡图”融合于同一可视化界面中：左侧以桑基图的流带形式，清晰展示功能类别与具体通路之间的层级归属关系；右侧以分组气泡图呈现每条通路在各组中的富集结果，其中气泡大小代表富集基因数目，颜色映射显著性强弱。该组合图表不仅保留了功能分类的层次结构，也便于横向比较不同组间的富集差异，尤其适用于多组GO、KEGG等富集结果的综合性展示。
2026-09-02 14:18:15
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原创 多肽药物的成功案例解析
多肽分子通常介于小分子药物和抗体药物之间。一方面，它比抗体更短、更容易合成和修饰；另一方面，它又能通过多个氨基酸残基与靶蛋白形成较大的相互作用界面，因此特别适合受体配体识别、蛋白-蛋白相互作用、病毒融合、离子通道调控等场景。
2026-07-13 14:47:05
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原创 放疗免疫抑制新机制：YTHDF2为关键免疫检查点
放射治疗是恶性肿瘤治疗的核心手段之一，但其临床疗效常受免疫抑制与肿瘤远处转移的制约，如何破解放疗诱导的免疫逃逸难题，提升放免联合治疗效果，是肿瘤免疫领域的研究热点。
2026-07-02 16:16:17
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原创 在线绘制venn图+柱状图组合图
venn+bar组合图，上半部分用venn图梳理数据集之间的交集情况，下半部分用柱状图直接展示各数据集的元素总数。逻辑与数据分离呈现，互不干扰，却互为补充。学会这一招，你的数据可视化瞬间提升一个专业层级。
2026-07-02 15:52:11
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原创 在线绘图：每组仅3个重复，PCA图别用椭圆用凸包
画PCA图时，如果每组只有3个重复，添加置信椭圆不靠谱，尤其当三点排成一线时椭圆会极扁甚至报错。而改用凸包，把实际数据点圈起来，仅用于探索性可视化，可以帮助读者直观看到各组占据的空间位置是否分开。
2026-06-29 16:52:35
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原创 在线绘制代谢组富集分析通路影响（pathway impact）气泡图
代谢通路富集气泡图：横轴为通路影响值（拓扑重要性，越大越好），纵轴为-log10(p)（越红越好）。优先锁定右上区域，结合各通路内代谢物丰度的升降趋势，判断通路的激活或抑制状
2026-06-29 16:41:43
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原创 动态交互式火山图：彻底解决基因名重叠、凌乱问题
动态交互式火山图，感兴趣基因名任意位置摆放，自带光环和引导线，彻底解决基因名重叠，凌乱问题，还你一张整齐、清新的SVG矢量火山图。
2026-06-15 14:33:58
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原创 微生信云平台复现Cell Reports高颜值多组误差柱状图
五种细胞系，四种浓度。颜色由浅入深的柱子自带“浓度递增”属性，X轴下方逐渐升高的黑色直角三角形再添一层视觉锚点。无需多余标注，读者一眼便能读懂浓度高低——这才是科研图表该有的模样。
2026-06-04 16:02:20
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原创 【Cell Metabolism同款】在线绘制摩天轮图展示不同通路中上下调基因个数
使用摩天轮图展示差异基因个数，内部的大圈代表差异基因总数，外周的小圈代表不同通路中所包含的差异基因数量。圈的大小与基因数目成正比。形象且直观。
2026-06-04 15:54:39
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原创 在线绘制Nature Genetics同款极坐标分组柱状图
告别单调直角坐标，极坐标分组柱状图以圆形艺术重塑数据之美！它在紧凑空间高效容纳多维信息，让数据故事脱颖而出。
2026-05-12 17:55:29
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原创 上下调基因可视化新视角：半圆图的直观之美
每个半圆的面积对应差异基因的数量，上半圆为上调，下半圆为下调。多个半圆形并排排列，便于横向比较不同处理组在调控方向与幅度上的整体差异，信息密度高且解读直观，化腐朽为神奇。
2026-05-12 17:24:30
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原创 在线绘制热图+bar图组合组展示基因表达差异
将z-score表达热图与log2FC条形图并列，使表达异质性、聚类特征与差异变化方向和幅度一目了然，并通过两者趋势的一致性实现了对关键基因的视觉双重验证。
2026-05-06 15:55:47
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原创 在线绘制配体-受体相互作用edge bundle图
当你的网络图变成一团毛线时，不妨问问自己：“我究竟是执着于每条线，还是想看清整个网络的故事？”如果答案是后者，Edge Bundle 可能就是你的第一选择。
2026-05-06 15:15:42
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原创 聚类和流向：在线绘制热图+桑基图组合图展示基因表达和所属通路
热图清晰展示差异代谢物在两组细胞中的表达模式，桑基图将代谢物关联至各自所属的代谢物类别。热图+桑基图组合图整体布局层次分明，便于快速识别受干扰的关键代谢物。
2026-04-30 14:56:05
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原创 在线绘制Nature Genetics同款带背景的GO富集条形图
富集分析结果条目繁多，不同分组的条形不易区分。采用背景色分区，将各分组的条形置于不同色块背景中，这一简单优化即可显著提升视觉清晰度，方便快速对比与解读。
2026-04-30 14:51:47
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原创 【项目文章：IF26.6】实体肿瘤免疫治疗的突破：三特异性抗体提供新的治疗选择！
在实体瘤免疫治疗领域，根据肿瘤微环境中免疫细胞浸润程度，类型及功能，肿瘤被分为了冷肿瘤和热肿瘤。热肿瘤的微环境中存在大量肿瘤特异性T细胞，免疫浸润丰富，而冷肿瘤则相反，肿瘤微环境中肿瘤特异性T细胞数量极少，同时伴随免疫抑制细胞富集，形成一个强免疫抑制微环境。
2026-01-22 17:03:47
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原创 在线绘制带分组的圆圈热图以展示数值变化
《广雅》有云：“玦（jué）如环，缺而不连”。让热图化身为首尾相望的圆环，在有限的空间里，让元素如星辰般环列延展。这是科学与美学的共舞：以“不完整”的形态，承载更完整的生物医学故事。
2026-01-22 15:27:20
1061
原创 Python float() 函数合法输入类型
一直以为float(' 123.45 ')是会报错的，1_23.45也是会报错的。总结了下float的使用场景，供大家参考。
2026-01-19 15:50:53
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原创 在线绘制特殊形状（三角行，菱形，五边形，六边形，椭圆，圆形）聚类热图
当热图褪去方正的色块，化为一片星罗棋布的圆形矩阵，数据的呈现便瞬间轻盈而灵动。
2026-01-19 15:48:26
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原创 在线绘制染色体叠加密度和标记图
生物信息学数据分析的本质在于解决实际的生物学、医学问题。将诸如基因密度、标记基因等特征在染色体上进行可视化展示，能够帮助我们更直观地将分析结果与生物学意义联系起来。
2026-01-04 16:16:39
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原创 在线绘制Nature Communication同款p值渐变的富集分析结果条形图
《Nature Communication》文章Endothelial RAB5IF is required for pathological and developmental retinal angiogenesis. Fig 5B （左图）的渐变条形图展示了蛋白组中上调蛋白的显著富集条目。X轴是-log10(Pvalue)，Y轴是富集条目，条形颜色以-log10(Pvalue)进行映射。
2026-01-04 16:07:05
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原创 在线绘制Nature Communication同款两组数据交集venn+Bar组合图
将传统维恩图与条形占比图相结合，在展示集合关系的同时，直接呈现各部分的数量与比例，避免了读者的心算过程，提升了信息传达的效率和准确性。
2025-12-25 15:42:30
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转载 最新综述:RNA修饰（RNA modification）系统作为疾病治疗靶点
RNA是真核生物中不可或缺的分子，承担着将遗传信息转录并传递的功能，构建起DNA和蛋白质之间的桥梁。有关RNA修饰的生物功能研究已经持续了相当长一段时间，对于RNA修饰对靶分子、信号通路、疾病的影响已经积累了一定的基础，作为长期投入表观转录组学的研究者，一定非常关心，对于已知的RNA修饰相关调控蛋白（Writer, Eraser, Reader）在临床转换方面取得了哪些进步？RNA修饰离治疗疾病还有多远的距离？
2025-12-02 12:15:03
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原创 在线绘制展示两组学联合分析bar+dot图
水平条形图上叠加渐变散点，整合了 四个关键维度：基因列表（Y轴）、转录组倍数变化（条形长度）、表观组peak倍数变化（点位置）及其统计显著性（点颜色）。该设计通过整合两种组学数据，精准共定位协同变化的基因，为解析调控逻辑提供直观证据。
2025-11-25 11:26:41
994
原创 在线绘制展示基因集交集细节的网络venn图
传统韦恩图宏观展示基因集间的重叠数量，却无法揭示具体基因。网络韦恩图将每个基因视为节点，通过其空间布局直观呈现共有与特有基因。它使研究者能够直接锁定关键候选基因，如驱动核心通路的具体成员，实现了从“有多少”到“是谁”的洞察深化。
2025-11-25 10:49:27
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转载 【项目文章 IF12.5】纽科生物助力肝硬化突破性细胞疗法临床研究
在全球范围内，肝硬化仍是威胁人类健康的 “隐形杀手”—— 它由慢性肝病逐步发展而来，最终可能导致肝衰竭或肝癌，而当前唯一的根治手段肝移植，却受限于供体短缺和手术风险。不过，近期发表在《Cell Discovery》上的一项研究，为肝硬化治疗带来了新希望：上海交通大学医学院附属仁济医院夏强院士与鄢和新教授团队通过化学重编程技术将人类原代肝细胞转化为可扩增的肝前体细胞（HepLPCs），揭示了其安全治疗肝硬化的核心机制。
2025-11-18 12:11:14
273
微生信GOID批量转名字并添加BP，MF，CC分类
2023-09-19
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