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RSS订阅原创 高分生信套路，免疫预后模型结合临床样本验证
本研究基于TCGA、GEO等5个数据库的乳腺癌患者数据，构建了一个免疫评分预后模型。通过分析6844例样本，确定了6种关键免疫细胞特征，建立的风险评分模型能有效预测患者生存期。验证结果显示，低风险组患者20年生存率显著高于高风险组(37.8% vs 20%)。该模型还能预测化疗效果，并与TNM分期等临床特征显著相关。研究还发现低风险组富集于T细胞信号通路，免疫检查点表达更高。通过整合临床指标构建的列线图进一步提高了预测准确性，为乳腺癌预后评估提供了新工具。
2025-12-18 14:28:47
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原创 医学生必备的10个SCI网站
本文介绍了10个实用的SCI文献检索与下载工具，包括PubMed、GeenMedical等常用检索网站，LetPub、Web of Science等期刊查询平台，Sci-Hub、Sci-down等免费下载网站，以及科研通文献互助平台。此外还推荐了Springer、JournalGuide和JANE三个选刊工具，这些资源能有效提升医学生和科研工作者的文献查阅效率，提供影响因子查询、期刊匹配、文献互助等实用功能。
2025-12-18 14:10:00
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原创 读文献先读图：文献中的结果图怎么看？
科研文献常见结果图解析指南：6种图表快速解读技巧。包括GO弦图（基因与生物过程关联）、KM生存曲线（生存率统计分析）、UMAP图（单细胞数据降维可视化）、UPSET图（疾病交集分析）、相关性热图（变量关联程度）和箱线图（数据分布特征）的识别要点。每种图表均标注核心要素：坐标轴含义、颜色标识、统计显著性标记等关键解读信息，帮助科研新手快速理解文献结果，提升文献阅读效率。
2025-12-17 14:51:18
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原创 你的稿件状态改变了么？投稿状态知多少，只看这一篇就够了
SCI论文投稿全流程解析：从投稿到审稿的12种状态 本文系统梳理了SCI期刊投稿的完整流程，重点介绍了稿件提交后的12种常见状态。包括初始投稿(Submitted to Journal)、编辑处理(Witheditor)、审稿人邀请(Reviewer(s) Invited)、审阅阶段(Under review)等关键环节，小修(Minorrevision)和大修(Majorrevision)的区别与应对策略。
2025-11-15 11:18:10
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原创 研究生必看！十二款超实用的科研工具，让你效率翻倍！
科研必备工具推荐助力高效科研。谷歌学术、PubMed、Web of Science提供海量学术资源；Mendeley、Zotero等文献管理工具帮助整理参考文献；ScholarRead、小绿鲸等整合阅读翻译功能，提升文献阅读效率。这些工具涵盖文献检索、管理和阅读全流程，让科研工作事半功倍
2025-11-15 10:37:08
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原创 一区8.5分，MIMIC数据库：甘油三酯-葡萄糖（TyG）指数与重症脓毒症患者住院死亡率的相关性分析
本研究基于MIMIC-IV数据库探讨了甘油三酯-葡萄糖(TyG)指数与脓毒症患者预后的关系。通过对1,257例脓毒症患者的分析发现，高TyG指数组患者具有更高的SOFA评分、更长的住院时间及显著升高的死亡率(院内21.4%，ICU15.43%，28天26.17%)。多因素分析显示TyG指数与死亡风险呈线性相关，经机器学习和亚组分析验证结果稳定。研究提示TyG指数可作为评估脓毒症患者胰岛素抵抗和预后的有效指标，但需前瞻性研究进一步验证其临床应用价值。该研究为脓毒症风险管理提供了新的代谢指标参考。
2025-11-11 15:38:16
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原创 保姆级CHARLS数据库使用教程
CHARLS是中国中老年健康追踪调查项目，由北京大学国家发展研究院主持，自2011年起开展全国性追踪调查。该项目覆盖28个省份的45岁及以上人群，提供个人健康、经济状况、社会保障等多维数据。研究者可通过官网注册申请数据，审核通过后可下载问卷及统计格式数据文件。数据分析需结合用户手册处理变量、缺失值及多层面数据结构。该数据库为经济学、社会学等领域的中国老龄化研究提供了高质量微观数据支持。
2025-11-11 15:34:09
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原创 热图怎么看？
热图是一种以颜色的变化来表示数据矩阵或数据集中程度的图表工具。通过颜色的深浅来表示数值的大小，颜色越深表示数值越大，颜色越浅表示数值越小。在生物信息学中，热图常用于展示基因表达、蛋白质相互作用、代谢途径活性等方面的数据信息。例如，在基因表达研究中，热图可以展示同一基因在不同组中的表达水平，通过色阶变化显示表达量高低。能够直观地展示数据的分布情况，发现数据之间的关联性，并突出显示具有显著特征的数据点。
2025-10-09 19:00:00
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原创 如何查找感兴趣的通路：KEGG数据库（一）
在生信的学习中，大家都会听说过KEGG富集分析，而且该方法在高通量测序分析中已然成为数据分析中必不可少的一环。这种分析方法依托的是由 Kanehisa实验室 在1995年开发的KEGG数据库，全称为 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（京都基因与基因组百科全书）。KEGG包含多个子数据库，有代谢通路、基因信息、化合物、酶、药物等等，以及最经常使用的Pathway通路信息 (分析一般需要借助其他工具，如DAVID、KOBAS等)可与其他大型数据库链接，可同时
2025-09-28 13:45:51
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原创 相关性热图怎么看？
相关性热图通过颜色和大小直观展示变量间的相关性：红色/蓝色分别表示正/负相关，颜色越深、方块越大表示相关性越强（系数±1）。横纵坐标对应变量，线条粗细和颜色反映显著性水平。广泛应用于基因共表达分析、蛋白质/代谢物互作研究及临床特征关联分析，帮助我们快速发现潜在调控网络和分组差异。
2025-09-28 11:54:26
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原创 3区4.5分，NHANES数据库探索超重或肥胖老年人睡眠时长和认知障碍的阈值效应
这篇文章基于NHANES数据库数据，深入探讨了与超重/肥胖老年人群中睡眠时长与认知功能之间的关联。该研究通过大量样本数据、多模型及亚组分析，探索了最佳睡眠时间，为通过睡眠管理改善特定人群的认知健康提供了科学见解。
2025-09-18 18:30:00
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原创 ROC曲线怎么看？
受试者工作特征曲线（receiver operating characteristic curve, 简称ROC曲线）是一种评价分类方法/模型的可视化工具。其基本原理在于将病例与非病例的预测值从小至大排序，即可划分为一系列截断值（cut-off value）。对应每个截断值可计算相应的灵敏度和特异距离坐标轴左上角最近的坐标点，可同时满足筛检试验的灵敏度和特异度相对最优，即为最佳截断值
2025-09-10 13:56:13
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原创 中医药方向网络药理学常用平台
近几年来，发文对于医学生、医生来说变成了越来越重要的手段。但是中医药方向临床数据难获取，中药的研究又很复杂，很多人会选择以网络药理学去切入。今天就给大家分享一些常用的网络药理学数据库
2025-08-29 18:15:00
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原创 PCA图怎么看？一分钟看懂主成分分析
主成分分析（PCA）是一种用于数据降维、特征选择的统计分析方法，目的是减少数据的维度，同时保留尽可能多的信息。找到一个新的坐标系，使得数据在新的坐标系下的方差最大。
2025-08-29 14:10:07
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原创 读文献先读图：UpSet图怎么看？
UpSet图是一种多集合交叉关系可视化工具，通过「点阵图+柱状图」的组合，直观展示多组数据的共有元素数量、分布规律及特征关联性，常用于展现基因组学，转录组学，蛋白质组学、疾病等数据集合之间的交集关系。
2025-08-14 20:00:00
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原创 R语言基因ID转换
基因ID转换可分为在不同物种间的Gene ID转换和同一物种不同基因ID类型的转换。今天分享的主要内容是针对同一物种不同基因ID类型的转换。
2025-08-14 20:00:00
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原创 KM生存分析怎么看？
生存曲线又称Kaplan-Meier曲线，用于描述研究群体在一定时间内的生存概率，从而评估不同因素或治疗对生存率的影响。今天我们就来讲解下KM生存曲线怎么看
2025-08-07 17:20:11
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原创 读文献先读图：GSEA图怎么看？
GSEA（基因集富集分析）是一种用于评估基因集在基因表达数据中的富集程度的方法，判断这些基因集对特定表型的贡献程度。
2025-07-24 16:03:42
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原创 读文献先读图：小提琴图怎么看？
小提琴图（Violin Plot），是一种集成了箱线图和核密度图特征的数据可视化图形，用于展示多组数据的分布情况和概率密度。不仅能够直接体现数据的分布形态，又能能够简单明了地展示异常值、四分位数、中位数等关键数据
2025-07-24 16:00:47
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原创 读文献先读图：韦恩图怎么看？
韦恩图是一种用于展示集合之间关系的图表工具，它由一系列相互交叠的圆组成，每个圆代表一个集合。这些圆有重叠的部分，用于表示两个或更多个集合之间的共同元素。图中的非重叠部分则表示各个集合的独立元素。
2025-07-15 17:00:00
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原创 7.5分网络毒理学，网药的这个思路太好抄了
随着人工甜味剂（Artificial Sweeteners, AS）的广泛使用，其潜在健康风险特别是与癌症发生的关系仍然存在争议。这项研究通过网络毒理学、分子对接、分子动力学模拟、机器学习、HPA验证等方法，旨在揭示AS与癌症风险之间的关联。
2025-07-15 11:06:00
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原创 R语言绘图：韦恩图
韦恩分析（Venn Analysis）常用于可视化不同数据集之间的交集和并集。维恩图（Venn diagram），也叫文氏图、温氏图、韦恩图、范氏图，用于显示元素集合重叠区域的关系型图表，通过图形与图形之间的层叠关系，来反应数据集之间的相交关系。
2025-07-03 17:18:56
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原创 读文献先读图：气泡图怎么看？
富集分析是指与所有鉴定到的目标代谢物、蛋白质、基因背景相比，差异代谢物、蛋白质、基因中显著富集到的功能条目，从而给出差异代谢物、蛋白质、基因与哪些生物学功能显著相关。富集气泡图是其中一种展现形式，适用于各种功能性数据库，常用的有GO数据库、KEGG数据库
2025-07-03 17:15:39
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原创 R语言绘图：小提琴图
小提琴图（Violin Plot），是一种集成了箱线图和核密度图特征的数据可视化图形，用于展示多组数据的分布情况和概率密度。
2025-07-02 20:00:00
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原创 【在线课程】NHANES数据库全面解析与实操演练part1
给大家分享一套泉方未来学习中心的NHANES数据库课程内容为NHANES数据库全面解析与实操演练，第一部分：课程导学及NHANES介绍及选题策略。干货满满，欢迎大家在线观看。
2025-07-02 15:48:08
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原创 各种富集分析结果一文看懂
富集分析是指与所有鉴定到的目标代谢物、蛋白质、基因背景相比，差异代谢物、蛋白质、基因中显著富集到的功能条目，从而给出差异代谢物、蛋白质、基因与哪些生物学功能显著相关。富集气泡图是其中一种展现形式，适用于各种功能性数据库，常用的有GO数据库、KEGG数据库、COG/KOG数据库等。可从不同的方面了解代谢物、蛋白质、基因参与的生理功能、结构特征、亚细胞位置等，进而揭示代谢物、蛋白质、基因在各个生命活动中的生物学意义。
2025-06-16 14:10:10
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原创 读文献先读图：火山图怎么看？
火山图（Volcano plot）是散点图的一种，它将统计测试中的统计显著性量度（如p-value）和变化幅度相结合，从而能够帮助快速直观地识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据点（代谢物等）。是一种单变量统计分析方法，常应用于研究基因组、转录组、代谢组、蛋白质组等数据分析
2025-06-16 09:11:06
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原创 读文献先读图：GO弦图怎么看？
GO弦图（Gene Ontology Chord Diagram）是一种用于展示基因功能富集结果的可视化工具，通过弦状连接可以更直观的展示基因与GO term（如生物过程、分子功能等）之间的关联。
2025-06-11 16:40:57
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原创 读文献先读图：UMAP图怎么看？
UMAP（Uniform Manifold Approximation and Projection）是一种非线性降维算法。通过降维，将高维数据分布在一个低维空间中，使得具有相似基因表达模式的细胞在图中聚集在一起，形成不同的聚类。既保留了数据的局部结构，也在一定程度上保留了全局结构。
2025-06-11 10:41:49
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原创 矫正牙齿，还可以学习网络药理学？你不是在骗我吧？
除了口腔正畸的原因，其他如牙髓炎、根尖周炎、外伤等原因，均可造成我们的牙根出现吸收现象。可见，牙根吸收还是很可怕的，所以平时就需要保护好我们的牙齿哦。Hello，各位小伙伴们，我是喵学姐，有段时间没有推出生信之类的知识啦。没错，在今天的这期课程里，TCGA、GEO、PPI网络、以及LASSO分析、机器学习模型等等，这些，我们……活性成分的作用靶点有很多，成百上千，但并不是每一个靶点都有作用价值，因此需要通过各种方法进一步筛选、过滤无效基因。可是，在你看不见的地方，可能你的牙齿是！可能松动了，也可能。
2023-10-20 09:05:02
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