生信菜鸟1号-优快云博客

原创 R中利用ggplot2绘制气泡图

利用R中的ggplot2包绘制气泡图，是一种直观而有效的数据可视化方式。通过调整气泡的大小、颜色以及坐标轴的设置，可以展示多维数据的关系。气泡图在多个领域都有广泛的应用，尤其是在需要展示三个变量关系的情况下，其清晰且富有表现力的图形特征，使得它成为数据分析和决策支持中不可或缺的工具之一 (文中介绍及结论来自Chatgpt4.0，我是真的懒得扩展这些东西，真想只放代码)。

2024-12-06 17:18:19 2100

我们需要自己把感兴趣的基因的CDS和UTF给取出来。也就是gtf文件的1，3，4，5列，当然有的基因因为选择剪切的缘故可能有多个转录本，我们自行选择想要的转录本的结构就好。注意各个结构范围不要有重叠的地方，多个结构要对应一个转录本。在绘制之前我们需要得到基因的具体结构信息，所以我们需要下载对应物种对应版本的基因组gtf文件。具体文件格式如下，包含基因各个结构的具体位置。在平时研究中我们找到某个基因，需要把这个基因结构可视化出来，ggbio就可以进行基因结构图的绘制。得到的图片直接在AI中美化就好。

2023-11-17 16:03:38 1370

weixin_45694863的博客

原创 R中利用ggplot2绘制气泡图

原创 ggbio进行基因结构图的绘制

原创 Bulk RNA-seq上下游分析

原创 ERROR: sequence and quality have different length:

原创 HTTPSConnection 发生错误ssl.SSLEOFError: EOF occurred in violation of protocol (_ssl.c:841)

原创 convert: attempt to perform an operation not allowed by the security policy `PDF‘ @ error/constitute

原创【无标题】

原创【无标题】

原创在R中利用circlize绘制圈图

原创 ggplot绘制柱形图(geom_bar)

原创 ggplot进行曼哈顿图复现

原创 ggplot中修改坐标的顺序

原创 R绘制折线图 geom_line and geom_ribbon

原创 SMC++进行有效种群分析

原创 MSMC2进行历史有效种群大小计算

原创 R绘制error bar图

原创利用admixtools进行群体分析

原创 pheatmap绘制热图

原创 R中ggplot2绘制直方图(histogram)

原创 PSMC包解压失败(aux.c，aux.o)

原创 Aspera 下载EBI上的fastq文件出错

原创关于linux中出现/dev/nvme0n1p1:clean界面的解决方法

原创 ggplot中删除legend

原创使用bcftools对bam文件call vcf

原创 beast附加包安装：SNAPP安装出现问题的解决办法

原创 smc++安装

原创 number of items to replace is not a multiple of replacement length

原创 CMplot与曼哈顿图

原创 R中不同类型的基因名间的转换

原创 ggtreeExtra安装失败

原创 ggplot中color和colour

原创 2021-09-09

原创 2021-09-09

原创 2021-06-05

原创 R中SingleR的本地安装

空空如也

空空如也