生信技能14 - 计算人类基因组每条染色体的长度

最新推荐文章于 2025-11-25 14:03:37 发布
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分类专栏： 生信分析项目实战技能合集 文章标签： 数据分析 python
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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/LittleComputerRobot/article/details/129113903
本文介绍了如何使用Python从Ensembl下载人类基因组hg38.fa文件，并通过解析文件计算出每条染色体的长度，包括chr1到chrY的所有染色体。

数据下载

从Ensembl下载人类基因组hg38.fa序列文件（约3GB）

python程序

import re
import fileinput

hg38 = "hg38.fa"
list_chr = {
   
   }
temp_chr = ''

for line in fileinput.input(hg38
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