生信技能14 - 计算人类基因组每条染色体的长度

本文介绍了如何使用Python从Ensembl下载人类基因组hg38.fa文件,并通过解析文件计算出每条染色体的长度,包括chr1到chrY的所有染色体。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

数据下载

从Ensembl下载人类基因组hg38.fa序列文件(约3GB)

python程序

import re
import fileinput

hg38 = "hg38.fa"
list_chr = {
   }
temp_chr = ''

for line in fileinput.input
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

生信与基因组学

每一份鼓励是我坚持下去动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值