lammps 报错总结

本文源于自己在学习过程中的问题及解决办法记录，仅供大家参考，可能表述并不准确，欢迎批评交流！

ERROR on proc 0: Neighbor list overflow, boost neigh_modify one or page

出现这个错误的直接原因是体系中某些原子的近邻数超过了2000个（除非你使用neigh_modify命令增加了允许的近邻数），而导致这个错误的可能因素有：

1. 初始结构有问题，比如原子分布过于密集。这种情况在一开始就会出错。
2. 截断半径设置的太大了，比如大于10A。可以通过命令neighbor，减小截断半径来解决。
3. 在 neigh_modify 添加 one 参数
4. 势参数设置有问题，这种情况一般是在运行一些步后才会出错。
   本文直接翻译自网页：http://lammps.sandia.gov/threads/msg36842.html

ERROR on proc 12: Angle atoms 69338 69339 69340 missing on proc 12 at step 38110 (…/ntopo_angle_all.cpp:68)

相似报错还有键bond缺失，解决办法如下：

1. 初始模型是否正确，确定建模方法及参数。这里重点仔细检查，由于无法可视化，或者无法直观的观察，这里错误的可能性比较大。
2. 参数设置错误
   a. 势函数是否正确，如果能从文献中确定比较好。
   b. neighbor
   在前期优化结构的过程中，由于结构极度不合理，可临时调大bin值，同时仔细查看neigh_modify的参数，进行合理的修改，如

neighbor