分子动力学软件LAMMPS学习--常见错误运行

本文介绍了LAMMPS分子动力学软件在使用过程中可能遇到的常见错误,如文件打开失败、力场文件缺失、邻居列表溢出、未设置pair_coeff参数、无效的hybrid子风格及未定义的组ID,并提供了相应的解决办法,旨在帮助新手用户更好地理解和解决运行问题。

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相信很多新手小白在使用lammps都时都会遇到到运行错误,但是你又不知道是哪里错误,那你可以来看看这篇文章,主要说明了几种常见的运行错误,会给你带来很大的帮助。

分子动力学模拟是一种研究分子体系结构与性质的重要方法,已被广泛用于化学化工、生物医药、材料科学与工程等学科领域。计算机模拟的方法省时省力,可以用来求解解析理论无法求解的问题,模拟实验做起来困难或不可能做的条件,得到更贴近实际体系的结果。LAMMPS分子动力学程序是一款开源而免费的软件,常用于模拟液体中的粒子,固体和汽体的系综,也可以采用不同的力场和边界条件来模拟全原子,聚合物,生物,金属,粒状和粗料化体系。

当然可以LAMMPS与分子动力学专项研究群:681058022,一起交流学习。

常见的错误运行

1. Cannot open file …

错误原因:

不能打开文件,大部分原因是输入的文件名错误或者文件不存在。

解决办法:

具体看提示的错误文件名和lammps停止在哪一行。

如lammps停止在read_data命令,需要检查in文件中的data文件名是否输入正确,或者文件夹内是否已经包含了data文件。

2.Cannot open EAM potential file

错误原因:不能打开eam力场文件。

解决办法:

检查力场文件名称是否正确,或者是

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