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原创 计算化学中的非均相催化-电催化体系
本文不仅介绍了计算化学的目标、非均相催化的理论框架,以及如何将非均相催化扩展到电催化,还探讨了计算氢电极、析氢反应、Scaling relation和火山图(Volcano Plot)在催化领域中的应用。
2025-12-30 16:07:26
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原创 电催化体系的第一性原理计算
本文不仅介绍了AIMD(从头算分子动力学)的基本原理及其在电催化体系中的应用和未来可能的发展方向,还重点讨论了采用恒电势法的原因、恒电势法的发展与应用,以及机器学习在化学催化领域的应用。
2025-12-30 15:47:21
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原创 VASP计算小分子气体能量和绘制ORR台阶图
本文介绍了如何使用 VASP 计算氢原子、氧原子和氧分子的能量,以及利用 VASP 研究 Pt (111) 表面氧还原反应(ORR)的催化过程,并绘制 ORR 台阶图。
2025-12-25 15:08:10
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原创 VASP计算Pt的表面能和吸附简单气体
本文介绍了如何使用VASP计算金属Pt的对称模型和非对称模型的表面能、如何基于Wulff规则构建纳米颗粒、如何计算Pt表面对CO的吸附能。此外,还介绍了CO吸附能的零点校正,以及气体吸附能的vdw校正和热力学校正。
2025-12-22 19:27:43
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原创 VASP基础入门教程
本文介绍了DFT理论基础、密度泛函理论及VASP的功能与适用范围,重点讲解了VASP的使用,包括结构计算、静态计算的相关命令、其核心参数设置及常见报错的解决方法。
2025-03-03 03:27:06
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原创 lammps应用于热电材料
本文介绍了LAMMPS在热电材料中的应用,介绍了热传导、傅里叶定律、非平衡分子动力学等理论基础,举例计算了Ar、SiGe等材料的热导率
2025-01-14 22:36:05
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原创 lammps应用于能源材料
本文介绍了lammps在能源材料研究中的应用,重点讨论了其在锂离子电池和储氢材料中的应用,如计算LiS电池的热膨胀系数和探究金属Mg的储氢机制
2025-01-12 01:55:42
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原创 lammps模拟热力学性质
本文介绍了LAMMPS在热力学性质计算中的应用,包括热膨胀系数、熔点、比热容和热导率的计算。重点讨论了LAMMPS如何模拟材料的熔化和凝固过程,分析了出现过冷或过热现象的原因
2025-01-03 08:15:00
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原创 lammps计算力学性质
本文介绍了LAMMPS在力学性质计算中的应用,包括平衡晶格常数、体积模量的计算,以及材料在拉伸和压缩过程中的模拟。
2024-12-31 02:17:46
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原创 lammps模拟气体扩散
本文介绍了分子动力学软件LAMMPS以及LJ(Lennard-Jones)约化单位制,重点讨论了如何通过LAMMPS进行气体扩散模拟
2024-12-31 02:02:00
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原创 分子动力学中优化算法和积分算法
本文详细介绍了分子动力学中的优化算法和积分算法,其中优化算法包括最速下降法和共轭梯度法;而积分算法涵盖了前向Euler算法、Verlet算法、Velocity Verlet算法和Leapfrog算法。
2024-12-27 19:38:39
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原创 周期性边界条件、近邻列表和原子间作用势
本文详细介绍了分子动力学中的周期性边界条件、近邻列表的构建与更新方法、势场的有效距离截断、以及温度和压强控制算法。重点讨论了常用的原子间作用势,如二体势、多体势和机器学习势,探究了它们在材料模拟中的应用与优势。
2024-12-25 23:25:29
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原创 计算材料学和分子动力学(MD)
本文详细介绍了计算材料学的基本概念及其研究尺度,阐述了分子动力学方法的原理、模拟步骤及其在材料研究中的优势,特别是在预测材料行为和优化性能方面的应用。
2024-12-23 22:57:26
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原创 python基础入门与进阶教程
本文介绍了Python的基础入门与进阶教程,重点介绍了Python在科研计算领域的常用模块,如Numpy、Matplotlib。
2024-08-15 01:01:12
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原创 lammps建模案例分享及详解
本文介绍了如何使用lammps提供的命令建立简单体系的模型,分享了一些lammps的建模案例。如遇到较复杂的模型,可选用Material Stdiuo等建模软件。
2024-07-07 23:44:50
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原创 lammps的in文件编写及代码分享
lammps是一种常用的分子动力学模拟软件,常用于模拟液态、固态或气态粒子的行为。在lammps中,输入文件是用于控制模拟的文本文件,通常以.in为文件后缀名。本文对in文件的编写做出了详细讲解,并分享了in文件的代码案例。
2024-07-06 01:33:25
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原创 利用DeepMD-kit训练神经网络力场
DeepMD-kit利用深度神经网络训练力场,可以达到DFT计算精度,在更大的空间尺度和时间尺度进行分子动力学计算。目前DP模型已成功应用于水和含水体系,金属和合金,高熵陶瓷,化学反应,固态电解质,离子液体等研究领域。
2024-07-02 17:34:49
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原创 深度势能生成器(DP-GEN)入门讲解
DP-GEN(Deep Potential GENerator)是一款用 Python 编写的软件,通过调用deepmd-kit,lammps和vasp,可生成基于深度学习的原子间势能和力场模型,其工作流程通常包括:训练,探索相空间和单点能计算。
2024-06-30 15:46:55
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原创 机器学习在材料预测方面的应用
机器学习已在设计新材料的领域取得了重要的成果。特别是在预测新材料的性能上,机器学习可大大缩短实验周期,降低预测成本,提高预测精度。
2024-06-22 22:17:32
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原创 使用Metropolis蒙特卡洛方法的原子模拟
原子模拟中,分子动力学和蒙特卡洛是常用的技术方法。分子动力学模拟是通过模拟原子的运动,获得材料的动态性质。而蒙特卡洛模拟通过随机采样,获得材料的静态性质。
2024-06-22 21:58:34
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原创 使用python编写data文件
虽然可以通过LAMMPS生成data文件来构建模型,但LAMMPS不擅长构造复杂模型。所以需要寻求其他方式来构造复杂模型,使用python可以较为简便的构造复杂模型。本文分享了用python编写data文件中的几个简单案例,希望能够帮助读者理解如何用python构造模型。
2023-07-02 19:38:41
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原创 计算模拟在计算材料学的作用
模拟计算在计算材料学中发挥着越来越大的作用,本文简单介绍模拟计算的相关概念,并阐明了模拟与实验的关系,同时指出模拟计算拥有不错的发展前景。希望能够帮助读者更好地理解模型、模拟和实验之间的关联。
2023-07-02 19:32:26
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原创 Java中数据类型的介绍与使用
本文简要介绍了计算机的基础知识和Java中的数据类型,希望能够帮助读者更好的了解Java中数据类型的介绍、分类和使用。
2023-03-11 00:29:27
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原创 第一性原理(DFT)基础知识
本文对计算模拟和第一性原理进行总结科普,重点介绍了第一性原理的基础知识,希望能够帮助初学者更好地了解计算模拟。
2022-12-21 21:55:50
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原创 lammps案例分享:流体通过多孔膜渗透模拟
分享一个简单的lammps模拟案例,模拟流体在刚性多孔膜的渗透流动,本文只模拟了50%膜对流体流动的影响,后续可以改变膜原子的比例来观察其对流体流动的影响。
2022-10-22 23:09:20
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原创 浅谈分子动力学(MD)模拟及其势文件
浅谈一下分子动力学模拟及相关知识,并简单介绍了一下势文件及势文件的拟合,希望能够帮助初学者更好地理解势文件和分子动力学模拟。
2022-10-21 22:57:26
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原创 lammps模拟中的常用计算命令
本文介绍了lammps模拟中常用的计算命令,希望能够帮助初学者更好的学习lammps,如果有错误,欢迎各位批评指正。
2022-10-15 23:58:44
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原创 在lammps模拟中常用的模拟设置
本文介绍在lammps学习过程中常用的模拟命令,希望能够帮助初学者更好的学习lammps,如果有错误,欢迎各位批评指正。
2022-10-15 23:40:40
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原创 lammps和atomsk中常用的建模方法
当在模拟过程中需要较为复杂的模型时,仅靠lammps建模已经不行。需要lammps和atomsk共同协助来帮助我们建立复杂的模型,本文介绍在lammps和atomsk中常用的建模方法,希望能够使初学者更好的建立较为复杂的模型。
2022-09-25 12:05:24
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原创 lammps模拟过程中的简单建模方法及举例
在分子模拟过程中,建立合适的模型是模拟进行的首要前提。但在lammps中只能建立简单的模型,当遇到复杂的模型时,则需要通过atomsk等专业软件进行辅助。本文介绍了在lammps中的简单模型建立,希望能够帮助初学者加深对模型建立的了解。
2022-09-25 11:39:22
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原创 在lammps模拟过程中的常用势函数设置
在lammps模拟中,势函数的使用必不可少。如何选择合适的势函数?如何设置势函数?这对初学者来说较为困难,本文介绍在lammps模拟中常用的势函数如何使用,希望能够帮助初学者加深对势函数的了解。
2022-09-25 11:13:38
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原创 进阶篇:使用Tensorflow构建神经网络
本文介绍了如何使用Tersorflow构建神经网络,以及神经网络在手写识别中的应用,并其中可使用离散化权重来改进算法,希望能帮助初学者更好学习神经网络。
2022-07-06 20:52:39
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原创 基础篇:简单神经网络模型的构建
本文介绍了神经网络的模型组成与构建,以及需要的相关基础知识,并列举了神经网络中常用的激活函数、损失函数和优化器,希望能帮助初学者更好地理解神经网络的组成与计算原理。
2022-07-03 16:15:06
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原创 分子动力学模拟基础(二)
介绍分子模拟技术的分类与基本概念,着重介绍分子模拟过程中的主要的内部算法与方程,以及通过运动方程来解释分子模拟的基本原理,使读者能对分子模拟有一定的初步认识。
2022-04-28 21:32:04
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