
分子动力学
Jasonkun_3
这个作者很懒,什么都没留下…
展开
-
lammps 报错总结
ERROR on proc 0: Neighbor list overflow, boost neigh_modify one or page出现这个错误的直接原因是体系中某些原子的近邻数超过了2000个(除非你使用neigh_modify命令增加了允许的近邻数),而导致这个错误的可能因素有:初始结构有问题,比如原子分布过于密集。这种情况在一开始就会出错。截断半径设置的太大了,比如大于10A。可以通过命令neighbor,减小截断半径来解决。势参数设置有问题,这种情况一般是在运行一些步后才会出错。原创 2020-09-14 16:41:42 · 29876 阅读 · 8 评论 -
lammps学习记录(一)CG(粗粒化)模型建模
以下均在wsl 1-Ubuntu 20.04中操作一、建模部分软件安装及准备所用软件:moltemplate http://www.moltemplate.org/visual_examples.htmlpackmol http://sobereva.com/473安装软件:moltemplate:a. 安装pip https://linux.cn/article-10110-1.htmlpython2 –version # 查看python版本sudo apt install原创 2020-08-12 11:18:55 · 11203 阅读 · 11 评论