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生信入门,零基础转录组分析

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原创 零基础入门生信转录组数据分析——导读

转录组数据分析(上游,下游,数据可视化)专栏的目录,可以直接通过点击各个分析点直接跳转到相关帖子,方便查找和观看

2024-10-18 15:38:25 4309

原创 零基础入门转录组数据可视化——绘制相关性散点图(常规)

转录组数据可视化之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍相关性散点图绘制的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-27 08:10:41 114

原创 零基础入门转录组数据可视化——绘制相关性热图(常规)

转录组数据可视化之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍相关性热图绘制的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-27 08:09:58 28

原创 零基础入门转录组数据可视化——绘制相对丰度图(常规)

转录组数据可视化之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍相对丰度图绘制的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-25 10:03:43 27

原创 零基础入门转录组数据可视化——绘制染色体定位圆圈图(常规)

转录组数据可视化之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍染色体定位圆圈图绘制的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-25 10:02:57 154

原创 零基础入门转录组数据可视化——绘制交集韦恩图(常规)

转录组数据可视化之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍交集韦恩图绘制的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-04 10:46:51 222

原创 零基础入门转录组数据可视化——绘制差异热图2(常规)

转录组数据可视化之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍差异热图2绘制的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-04 10:38:28 96

原创 零基础入门转录组数据可视化——绘制富集分析网络图(常规)

转录组数据可视化之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍富集分析网络图绘制的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-03 16:41:32 247

原创 零基础入门转录组数据可视化——总览

本内容是生信入门转录组分析——数据可视化(初级)专栏的图片预览,方便大家了解专栏中都有哪些可视化图片

2025-03-03 16:40:29 82

原创 零基础入门转录组数据可视化——绘制富集分析树形图(常规)

转录组数据可视化之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍富集分析树形图绘制的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-27 11:31:21 41

原创 零基础入门转录组数据可视化——绘制差异小提琴图(常规)

转录组数据可视化之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍差异小提琴图绘制的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-26 07:49:22 88

原创 零基础入门转录组数据可视化——绘制富集分析柱状图(常规)

转录组数据可视化之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍富集分析柱状图绘制的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-26 07:48:25 106

原创 零基础入门转录组数据可视化——绘制差异箱线图(常规)

转录组数据可视化之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍差异箱线图绘制的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-25 08:05:53 458 1

原创 零基础入门转录组数据可视化——绘制差异热图(常规)

转录组数据可视化之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍差异热图绘制的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-25 08:04:27 711

原创 零基础入门转录组数据可视化——绘制差异火山图(常规)

转录组数据可视化之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍差异火山图绘制的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-24 10:49:36 801

原创 零基础入门转录组下游分析——单细胞转录组之基因在细胞水平的表达

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍单细胞转录组之基因在细胞水平的表达的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-24 08:49:27 737

原创 零基础入门转录组下游分析——单细胞转录组之不同细胞间差异分析

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍单细胞转录组之不同细胞间差异分析的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-20 08:22:43 1008

原创 零基础入门转录组下游分析——单细胞转录组之细胞注释

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍单细胞转录组之细胞注释的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-20 08:21:31 744

原创 零基础入门转录组下游分析——单细胞转录组之主成分分析与聚类降维

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍单细胞转录组之主成分分析与聚类降维的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-19 08:01:28 919

原创 零基础入门转录组下游分析——单细胞转录组之数据预处理

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍单细胞转录组之数据预处理的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-19 07:58:21 1249

原创 零基础入门转录组下游分析——基因突变分析

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍基因突变分析的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-18 09:47:25 749

原创 零基础入门转录组下游分析——GSVA富集分析

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍GSVA富集分析的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-17 09:33:57 1486

原创 零基础入门转录组下游分析——GSEA富集分析

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍GSEA富集分析的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-17 09:23:59 1710

原创 零基础入门转录组下游分析——免疫浸润之ssGSEA算法

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍免疫浸润之ssGSEA算法的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-12-31 08:25:05 1205

原创 零基础入门转录组下游分析——免疫浸润之CIBERSORT算法

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍免疫浸润之CIBERSORT算法的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-12-31 08:21:37 1676

原创 零基础入门转录组数据分析——列线图模型(诊断)

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍列线图模型构建和验证的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-12-30 11:26:53 1505 3

原创 零基础入门转录组下游分析——列线图模型(预后)

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍列线图模型构建和验证的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-12-30 11:24:42 1295

原创 零基础入门转录组下游分析——基因Wilcoxon秩和检验

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍单基因进行wilcoxon检验的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-11-17 20:25:19 1475 2

原创 零基础入门转录组下游分析——单基因ROC分析

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍单基因进行ROC分析的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-11-15 10:03:01 1575

原创 零基础入门转录组下游分析——预后模型的验证

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍模型验证的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-11-15 09:57:41 1287

原创 零基础入门转录组下游分析——预后模型之随机生存森林模型

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍构建预后随机生存森林模型并用模型计算风险评分的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-11-14 11:01:52 1322

原创 零基础入门转录组下游分析——预后模型之多因素cox模型(加逐步回归)

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍构建预后多因素cox模型(加逐步回归)并用模型计算风险评分的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-11-14 10:58:52 1335

原创 零基础入门转录组下游分析——单因素cox筛选预后相关特征

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍单因素cox筛选预后相关特征的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-11-13 15:02:07 1260

原创 零基础入门转录组下游分析——预后模型之多因素cox模型

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍构建预后多因素cox模型并用模型计算风险评分的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-11-13 15:00:37 1460

原创 零基础入门转录组下游分析——预后模型之lasso模型

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍构建预后lasso模型并用模型计算风险评分的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-11-01 15:24:21 1178

原创 零基础入门转录组下游分析——机器学习算法之xgboost(筛选特征基因)

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍用xgboost机器学习方法筛选特征基因的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-10-30 14:36:00 1771 6

原创 零基础入门转录组下游分析——机器学习算法之boruta(训练模型)

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍用boruta机器学习方法训练模型的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-10-30 14:33:52 1198

原创 零基础入门转录组下游分析——机器学习算法之boruta(筛选特征基因)

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍用boruta机器学习方法筛选特征基因的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-10-29 16:44:25 1895

原创 零基础入门转录组下游分析——机器学习算法之SVM-RFE(筛选特征基因)

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍用SVM-RFE机器学习方法筛选特征基因的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-10-29 16:42:54 2597 2

原创 零基础入门转录组下游分析——机器学习算法之lasso(筛选特征基因)

转录组数据分析之一,先介绍相关基础知识,其次用实际案例为基础,由浅入深介绍用lasso机器学习方法筛选特征基因的全过程,包括内容有相关代码和截屏。

2024-10-28 15:47:36 2267 2

零基础入门转录组数据可视化-绘制富集分析柱状图(常规)

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2025-02-26

零基础入门转录组数据可视化-绘制差异小提琴图(常规)

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2025-02-26

零基础入门转录组数据可视化-绘制差异箱线图(常规)

总目录跳转链接:https://daizhuer.blog.youkuaiyun.com/article/details/143053906(目录方便大家选择自己想要学习的知识点直接跳转) 压缩包内容包括如下: (1)输入数据 (2)R脚本 (3)输出结果(图片) R脚本已经测试过可以一键全选后跑通,压缩包内有配套数据,可用于直接练习,图片最终效果可见下方链接 教程链接:https://daizhuer.blog.youkuaiyun.com/article/details/145757732

2025-02-25

零基础入门转录组数据可视化-绘制差异热图(常规)

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2025-02-25

零基础入门转录组数据可视化-绘制差异火山图(常规)

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2025-02-24

零基础入门转录组下游分析- 染色体定位分析 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-基因突变分析 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-GSVA富集分析 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-GSEA富集分析 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-免疫浸润之ssGSEA算法 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-免疫浸润之CIBERSORT算法 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-列线图模型(预后) 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组数据分析-列线图模型(诊断) 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-基因Wilcoxon秩和检验 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-单基因ROC分析 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-预后模型的验证 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-预后模型之随机生存森林模型 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-预后模型之多因素cox模型(加逐步回归) 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-预后模型之多因素cox模型 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-预后模型之lasso模型 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-单因素cox筛选预后相关特征 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-机器学习算法之xgboost(筛选特征基因) 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-机器学习算法之boruta(训练模型) 教程配套资源

总目录跳转链接:https://daizhuer.blog.youkuaiyun.com/article/details/143053906(目录方便大家选择自己想要学习的知识点直接跳转) 零基础入门转录组下游分析——机器学习算法之boruta(训练模型) 教程配套资源 压缩包内容包括如下: (1)输入数据 (2)R脚本 (3)输出结果 R脚本已经测试过可以一键全选后跑通,有基础的朋友可以直接生啃代码,基础薄弱的朋友可搭配下方教程一起使用,效果更佳 教程链接:https://daizhuer.blog.youkuaiyun.com/article/details/143364246

2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-机器学习算法之boruta(筛选特征基因) 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-机器学习算法之SVM-RFE(筛选特征基因) 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-机器学习算法之lasso(筛选特征基因) 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-加权基因共表达网络分析 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-GO+KEGG富集分析 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-DESeq2差异分析 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-limma差异分析 教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-数据处理(GEO数据库-高通量测序数据)教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-数据处理(GEO数据库-芯片数据)教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-数据处理(TCGA数据库)教程配套资源

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2025-02-20

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