RNA Pull-down

RNA Pull-Down 是一种用于研究RNA与蛋白质相互作用的技术。通过生物素标记的RNA探针与细胞裂解液孵育，形成RNA-蛋白复合物，经链霉亲和素磁珠捕获并洗涤后，洗脱结合蛋白，利用Western Blot检测特定蛋白质。该方法广泛应用于鉴定RNA结合蛋白及调控机制研究。

背景说明

RNA结合蛋白（RNA binding protein，RBP）是一类功能强大而广泛的调节因子，约占细胞编码的所有蛋白的5%~10%。目前除了少数RNA以核酶形式单独发挥功能，大部分RNA通过与蛋白结合形成RNA-蛋白复合物来发挥作用。蛋白质与RNA的相互作用是许多细胞生物学过程的核心，如蛋白质合成、mRNA组装、病毒复制、细胞发育调控等，研究它们之间相互作用的分子机制对理解这些生物学过程非常重要。

RNA Pull-down作为研究RNA与蛋白互作的核心技术，是使用体外转录法标记生物素RNA探针，然后与胞浆蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合，通过生物素与链霉亲和素的非共价亲和作用，使其与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后，如果检测蛋白为已知蛋白，可通过Western blot实验检测特定RNA结合蛋白是否与RNA相互作用。如果检测未知蛋白，则可结合质谱（MS）进行鉴定特定RNA结合蛋白，以鉴定蛋白质类型。

图 RNA Pull-down 实验流程图。

服务流程

客户在线下单——订单/实验材料确认——DNA目的片段合成——体外转录——生物素标记——蛋白孵育——Pull-down实验——WB检测或质谱检测——项目报告

服务内容及说明

适用场景

1、验证已知RNA与蛋白的相互作用；

2、筛选与已知RNA相互作用的未知蛋白。 

优势特点

1、可富集检测低丰度RBPs-RNAs复合物；

2、体外直接转录目的RNA作为诱饵，避免了RNA互补探针导致的非特异性结果；

3、质谱鉴定具有高效、通量大的特点，可一次性获得可能与目的RNA互作的蛋白。

客户下单及项目信息填写

在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录，请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式，提交项目所需要的具体信息，包括：

1、组织、细胞等样品类型及目的基因种属、ID号与序列等相关信息；

2、样本数量、检测方法（可选WB或MS）；

3、尽可能丰富的相关资料、文献。

实验周期

致电详询

实验交付与标准

1、所有实验的原始数据（包括实验过程、实验试剂与设备等）；

2、详细实验报告及结果分析（可选Western blot或MS结果）；

3、RNA探针详情、基因合成测序报告以及目的基因质粒、菌液，测序报告。

我司采用体外转录法标记生物素RNA探针，默认RNA长度2000 bp以内，如有个性化要求，请致电详联

我司案例

图 LINC00501的RNA Pull-down 结果。