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RSS订阅原创 蛋白互作研究思路
研究蛋白-蛋白互作时，直接以两个全长蛋白进行分子对接并筛选最佳构象，这种方法虽然常见，但通常并非最稳妥的起点。原因在于，多数蛋白并不是一个简单整体，而是由多个结构域、功能区域、柔性连接区、无序区及重复区域组成。实际参与互作的往往不是全长蛋白之间的整体结合，而是其中特定结构域、功能区域，甚至短肽片段的参与。
2026-10-22 16:48:28
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原创 PLOS Pathogens（IF=4.9）2026|双链RNA病毒反义链微蛋白调控抗病毒免疫
长期以来，科学界普遍认为双链RNA病毒的反义链仅承担复制模板功能、不编码蛋白。但近期苏州大学团队在《PLOS Pathogens》发表题为“IRES-like element-mediated translation of vsp1S4(-) suppresses BmCPV replication via RNAi antagonism”的研究论文，挑战了这一传统认知，在家蚕质型多角体病毒（BmCPV）中首次鉴定出反义链编码的全新功能性微蛋白vsp1S4(-)。
2026-10-22 16:42:11
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原创 RNA修饰不止m⁶A｜Nature Plants重磅综述解锁植物6类非m⁶A修饰如何重塑发育与逆境响应
长期以来，植物表观转录组领域的目光几乎全部聚焦m⁶A甲基化，然后数百种其他RNA修饰含量虽低却也在植物中发挥核心功能。最近发表于《Nature Plants》的重磅综述“Emerging roles of non-m⁶A mRNA modifications in plants”彻底打破这一固有认知：除m⁶A外，m⁵C、ac⁴C、假尿嘧啶Ψ、m¹A、m⁷G、2′O-Nm六大类非m⁶A修饰遍布植物mRNA，独立调控开花、根系发育、光合作用、高温/低温/病害胁迫响应，甚至直接决定水稻、小麦等作物产量。
2026-10-19 15:18:53
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原创 翻译组学研究技术上新
重磅上新！我司上线翻译组学全套测序技术服务，补齐转录组与蛋白组之间的研究空白，一站式提供 Polysome profiling、Polysome-seq、RNC-seq、 Ribo-seq、Disome-seq全套方案。覆盖动物、植物、微生物全物种；适配动物的心肝脾肺肾，植物的根、茎、叶、花、种子、果实等不同器官与组织类型的研究，可同步解析叶绿体、线粒体细胞器翻译调控。标准化实验流程 + 深度定制化生信分析，高效助力基因调控、抗逆胁迫、污染物降解、发育机制课题深度挖掘。
2026-10-19 15:11:56
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原创 PLOS Genetics（IF=3.9）|DAP-seq助力揭示TaWRKY58介导小麦生长及干旱胁迫应答的分子调控机制
TaWRKY58作为转录抑制子，形成一套完整调控模块，通过协同调控信号通路与线粒体能量代谢，精细权衡小麦生长发育和干旱胁迫适应的平衡关系。本研究为定向改良小麦、培育环境波动下产量稳定、抗逆优良的新品种提供理论基础与育种策略。
2026-10-19 14:51:56
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原创 New Phytologist（IF=8.7）|DAP-seq助力揭示OsMYB94调控水稻颖果成熟与品质形成的分子机制
OsMYB94是调控水稻颖果成熟的核心转录因子，可协同激活多条代谢通路正向改良稻米综合品质；本研究解析了OsMYB94-OsLTP5/OsLTPL12功能调控模块，为水稻优质性状的定向遗传改良提供了新型基因资源与理论支撑。
2026-10-19 14:26:28
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原创 Nat Commun（IF=18.1）▏DAP-seq助力揭示光敏色素整合茉莉酸与高温信号调控叶绿体发育分子机制
本研究系统阐明HY5与MYC2在叶绿体发育中的拮抗功能，揭示高温加剧JA诱导光合损伤的转录调控机制，填补了温热与JA信号交叉调控叶绿体发育领域的空白，为作物分子育种提供精准基因靶点。
2026-08-27 14:58:33
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原创 Nat Commun（IF=18.1）| DAP-seq和RNA-seq联合助力解析GbNAC072C介导海岛棉衣分的等位特异调控机制
GbDEAH12G-GbNAC072C-GbHOX3是调控海岛棉衣分与纤维发育的关键分子模块。本研究揭示了等位变异特异性蛋白互作调控海岛棉衣分的全新分子机制，填补了NAC转录因子参与棉纤维发育与衣分形成的研究空白，同时为海岛棉高产分子育种提供关键基因资源与育种改良靶点。
2026-08-27 14:46:02
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原创 Polysome profiling文章 | 在早期脑发育中ADAR3通过调控mRNA稳定性与翻译，抑制神经元分化
ADAR3是RNA腺苷脱氨酶家族中一个无催化活性的成员，本研究探讨了其在小鼠大脑发育中的功能。ADAR3的表达水平在胚胎发生过程中逐渐升高，而在出生后则下降。利用原代皮层神经元，作者发现在体外分化的神经元中，只有一部分亚群表达ADAR3，这表明ADAR3在大脑中并非充当ADAR编辑的通用调节因子，而是具有特定功能。ADAR3相互作用组的分析提示，其在mRNA稳定性和翻译过程中发挥作用。进一步分析发现，在原本不表达ADAR3的神经元细胞系中表达ADAR3，会改变大量mRNA的表达水平与稳定性。
2026-08-27 14:18:53
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原创 Plant Physiology（IF=8.2）▏DAP-seq助力揭示甘蓝型油菜BnaA9.NST3通过光周期途径调控开花的新机制
本研究首次在油菜中揭示了开花与次生生长的协同调控网络，丰富了开花调控的分子机理，也为培育花期适宜的甘蓝型油菜品种提供了候选基因靶点。
2026-08-27 13:58:10
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原创 Plant Biotechnol J（IF=12.8）|DAP-seq助力揭示茶树CsMYB82介导的炭疽病抗性调控网络
本研究系统阐明了CsMYB1‑CsMYB82/CsbHLH48‑CsCAD4转录模块调控木质素代谢进而影响炭疽病抗性的作用模式，填补了茶树木质素介导抗病机制的理论空白，也为抗病种质选育、绿色防控及分子育种提供了重要的基因资源和理论依据。
2026-08-27 11:23:32
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原创 Polysome-seq文章解读 | RNH1-ANG协同调节造血细胞与非造血细胞的全局翻译，揭示细胞类型特异性的翻译调控新机制
本研究聚焦于核糖核酸酶抑制剂1（RNH1）和血管生成素（ANG）协同调控造血细胞与非造血细胞的全局翻译。采用人类细胞系和小鼠模型，研究发现在造血细胞中RNH1缺失通过抑制核糖体蛋白mRNA的翻译和mRNA环化降低全局翻译；而ANG在非造血细胞中通过增加rRNA合成来补偿RNH1缺失导致的翻译缺陷。这项研究揭示了细胞类型特异性的翻译调节因子及其介导的翻译调控机制。
2026-08-05 14:38:54
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原创 转录组测序（RNA-seq）
转录组测序（RNA-seq）的研究对象是特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA的总和。RNA-seq是利用高通量测序技术进行cDNA测序分析，全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本，能够从整体水平研究基因功能以及基因结构，揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。图 2. 样本相关性热图。图3. 样本PCA聚类。图6. 差异分析散点图。图7. 差异基因火山图。图4. 样本聚类热图。图5. 样本基因韦恩。
2026-08-05 14:10:07
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原创 双荧光素酶报告实验（Dual-LUC）
双荧光素酶报告实验（Dual-luciferase reporter assay，DLR）是一种在生物学研究中广泛应用的技术，主要用于解析基因表达调控机制，可定量评估转录因子与靶基因启动子的相互作用及启动子活性。
2026-08-05 14:01:35
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原创 Plant Physiology（IF=8.2）|Dual-LUC助力揭示miR169y-PtrNFYA6-PtrNCEDs模块调控杨树ABA合成与抗旱性的新机制
本研究构建了完整的miR169y‑PtrNFYA6‑PtrNCED3a/3b/6信号级联模型。该模型不仅在理论层面深化了对木本植物抗旱分子调控网络的认识，也为实践中通过调控“生长‑抗性”权衡（Trade‑off）实现杨树抗旱智能育种提供了新策略。
2026-08-05 13:55:43
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原创 JGG（IF=7.9）| RNA-seq和Dual-LUC助力揭示番茄花序长度调控新机制
本研究揭示了SlDOF9–SlELP5分子模块调控番茄花序长度的分子通路，为理解番茄花序结构的分子调控网络提供了新见解，也为未来通过分子育种精准改良番茄花序性状、提高产量潜力提供了重要候选基因和理论基础。
2026-08-05 13:52:13
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原创 Nature Oncogene(IF：9.1) 2026|Ribo-seq与Polysome profiling联合构建OCCC翻译全景，揭示RBM4介导的翻译调控促癌新机制
OCCC是卵巢上皮癌罕见亚型，发病率3.7%~12.1%，对铂类化疗高度耐药，晚期患者5年生存率仅20%，复发风险极高；临床统一使用铂+紫杉醇常规化疗，缺少针对性靶向方案。既往OCCC多组学研究仅局限于基因组（ARID1A高频突变）、转录组RNA-seq、蛋白质质谱，完全缺失翻译层级的系统研究。2026.06.05北京协和医院团队在Oncogene（ Nature子刊）在线发表题为“The translation landscape of ovarian clear cell carcinoma indic
2026-07-27 15:06:47
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原创 J Integr Plant Biol（IF=9.3）|DAP-seq助力揭示多年生黑麦草LpMYBR1调控叶色的分子机制
该研究解析了多年生黑麦草中LpMPK6-LpMYBR1-LpNRT1.5的调控通路，完善了叶色与氮素代谢的分子机理研究，对培育低氮适应性强、观赏品质优良的草坪草品种具有重要指导意义。
2026-07-24 16:44:34
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原创 Cell ▏蓝景科信助力植物生物钟与植物免疫调控机制研究
本研究鉴定出全新非典型准昼夜节律基因调控网络（GRN），完成真核生物节律调控网络的体外异源重建，并明确该网络在果实免疫调控中的关键作用。该研究不仅揭示了采后植物器官中的生物钟调控机制，为全面理解生物钟和免疫的互作提供了重要的参考资料，也为未来果蔬保鲜提供了新的思考方向。
2026-07-24 15:04:27
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原创 Ribo-seq文献解读 | 小鼠棕色和白色脂肪细胞翻译图谱分析，鉴定代谢相关的小开放阅读框和功能性微蛋白
35(1):166-183.e11.本文利用Ribo-Seq分析了小鼠棕色、白色和米色脂肪细胞中的短开放阅读框（smORFs）和微蛋白（MPs），鉴定到未注释的、具有MP编码潜力的smORF 共3877个。近年来，随着核糖体图谱分析和质谱技术的快速发展，越来越多的微蛋白被鉴定出来，这不仅拓展了人们对蛋白质的理解，也为生命科学研究开辟了一个新方向。Ribo-Seq首次证实Gm8773在脂肪细胞中翻译，编码一个由132个氨基酸组成的分泌型微蛋白，与鸡和人的FAM237B同源（神经分泌蛋白GM，简写NPGM）。
2026-07-15 11:27:01
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原创 Ribo-seq文献 | 人脑中RNA翻译的发育动力学
通过对死后人脑组织及hESC衍生神经元的系统分析，本研究揭示了人类大脑翻译组的复杂性，强调了非典型ORF在脑发育与疾病中的潜在作用，为理解翻译调控在神经系统中的功能提供了重要资源，并为探索人类脑特异性微蛋白开辟了新方向。本研究绘制了人脑的动态翻译图谱，探讨了人脑发育过程中RNA翻译相关动态变化，揭示了基因表达调控的关键节点，并识别了数千个新的翻译事件，包括编码人脑特异性微蛋白的小开放阅读框（sORFs）。本研究绘制了人类大脑发育过程中的高分辨率翻译图谱，有助于阐明翻译调控的分子机制。
2026-07-15 11:16:59
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原创 PNAS(IF：10.6) 2026|Polysome profiling助力解析Aurora-A相分离介导肝癌索拉非尼耐药机制
有丝分裂激酶Aurora-A在多种癌症中频繁过表达，并参与肿瘤进展及治疗耐药性的形成，但其在耐药性中的具体作用机制尚不明确。索拉非尼应激→细胞翻译停滞→Aurora-A通过IDR的K/R结合RNA→发生LLPS→作为支架稳定G3BP1-RNA凝聚→SG高效组装→癌细胞抗凋亡→索拉非尼耐药；结论:Aurora-A不直接结合G3BP1，而是通过IDR直接结合RNA，以RNA为桥形成三元复合物。1.Aurora-A：经典有丝分裂激酶，肿瘤中高表达，与耐药相关，但非催化/相分离介导耐药机制不清。
2026-07-15 10:51:24
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原创 Advanced Science（IF=14.1）▏DAP-seq助力解析BnJAM3介导BnTFL1调控甘蓝型油菜种子糖转运与油脂合成的机制
旁系同源基因的表达模式。（B）将BnaA01.JAM3、BnaA03.JAM3、BnaC01.JAM3、BnaC07.JAM3蛋白分别与GFP融合，在本氏烟草叶片表皮细胞中观察其亚细胞定位。（A）采用RT-qPCR，在授粉后24、28、32、36天的发育种子中，检测受BnaC03.TFL1调控、参与油脂合成、贮藏蛋白合成、糖代谢及糖转运相关基因，在野生型。转录调控是种子油脂与蛋白质生物合成碳分配的核心环节，但目前协调油菜种子油脂、蛋白质平衡积累的关键调控因子及其分子机制仍不清楚。基因位点上的可视化峰图。
2026-06-25 16:54:31
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原创 一文读懂CUT&Tag：表观遗传研究的“精准定位神器”
（D、E）对照（D）与盐处理（E）根系H3K27me3峰的基因组分布，展示峰在启动子、基因区、基因间区及其他基因组元件中的占比。表观遗传学是解析生命现象调控机制的重要领域之一，其中蛋白质与DNA的相互作用（如组蛋白修饰、转录因子结合），在很大程度上影响着基因表达的时空特异性，也是连接基因型与表型的重要纽带，广泛参与各类生命活动的调控进程。逆境响应与抗病机制研究：挖掘非生物胁迫、生物胁迫下蛋白-DNA互作的动态变化与异常特征，阐明抗逆、抗病的分子调控机理，为作物分子育种、病害绿色防控提供靶点与理论支撑。
2026-06-25 15:53:34
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原创 双DNA亲和纯化测序（dDAP-seq）：转录因子复合体结合位点解析技术
双DNA亲和纯化测序（dDAP-seq）是在DNA亲和纯化测序（DAP-seq）技术基础上进化而来，其核心原理为：通过体外共表达两个带有不同亲和标签的转录因子，使其在体外形成异源二聚体，再与基因组DNA片段孵育结合，进一步富集与目的蛋白结合的DNA，经高通量测序及生物信息学分析，在全基因组范围内定位相互作用转录因子的结合位点。将dDAP-seq与DAP-seq联合应用，还可系统分析单转录因子与转录因子复合体DNA结合偏好特征与差异，为深入解析转录因子协同互作、精细绘制基因调控网络提供了全新解决方案。
2026-06-24 10:05:28
197
原创 Hortic Plant J（IF=6.2）|DAP-seq助力解析CsTCP2调控柑橘叶片大小的分子机制
本研究阐明了柑橘中TCP转录因子调控叶片大小的分子机制，不仅丰富了木本植物叶片发育的理论体系，也为柑橘株型改良、光合效率提升和优质育种提供了关键基因靶点与重要理论支撑。
2026-06-09 15:53:46
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原创 Current Biology（IF=7.5）|DAP-seq助力解析TI3调控柑橘刺身份决定的分子机制
该研究系统揭示了柑橘刺与分枝的命运抉择机制，填补了植物分生组织命运决定的理论空白，为培育无刺柑橘品种提供了关键靶点与理论支撑，具有重要科学价值与应用前景。
2026-06-09 15:50:00
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原创 THE EMBO JOURNAL（IF=8.3）▏DAP-seq助力揭示SlZHD8调控番茄果实糖积累的分子机制
本研究系统阐明了盐胁迫下根系信号调控果实增甜的分子机制，为逆境促品质这一重要农业现象提供了核心理论支撑，并为番茄品质与抗逆协同改良提供了关键基因资源与育种靶点。
2026-06-09 15:06:57
181
原创 Hortic Res（IF=8.5）▏DAP-seq助力解析SlbHLH70调控番茄耐旱性的分子机制
本研究系统解析了SlbHLH70调控番茄响应干旱胁迫的分子通路与作用机制，不仅深化了对植物抗旱机制的认识，更为番茄抗逆遗传改良提供了重要候选基因与理论支撑。
2026-06-09 14:59:40
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原创 生物大分子互作技术——Pull-down详解
分子互作是生命活动的基础，不同生物分子之间的识别、结合与调控，贯穿于基因表达、信号传导、细胞命运决定等几乎所有生命过程。生物分子间的相互作用（蛋白-DNA、蛋白-RNA、蛋白-蛋白）是生命科学研究的核心内容，也是揭示基因调控、蛋白功能及疾病机制的关键。Pull-down实验（又称拉下实验）既能用于筛选未知互作分子，也可用于验证已知分子间相互作用。根据研究对象的不同，主要分为蛋白Pull-down、DNA Pull-down和RNA Pull-down三大类。
2026-05-25 17:30:30
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原创 Plant Cell Environment（IF=6.3）▏DAP-seq技术助力揭示三叶草TaUPL21调控根系发育的分子机制
研究团队从高加索三叶草中鉴定出32个TaUPL基因，其中TaUPL21在根茎芽中特异性高表达，成为调控根系生长的核心候选基因。功能验证显示，过表达TaUPL21可显著提升根长、根体积、根尖数与根表面积，直接证实其正向驱动根系发育的关键作用。通过DAP-seq全基因组鉴定TaUPL21结合位点，两个生物学重复分别鉴定出1607和1066个结合峰，其中11.2%的峰位精准定位在基因启动子区域；GO与KEGG富集显示其靶基因参与次生代谢、基因组稳定、表观调控、胁迫响应与发育调控等多种过程。
2026-05-25 15:32:20
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原创 Advanced Science（IF=14.1）▏DAP-seq助力揭示CsYABBY3调控大麻腺毛分化与大麻素合成的分子机制
研究团队利用多品种大麻以及多组织部位转录组，筛选并鉴定出大麻腺毛特异性高表达的FIL/YAB3家族转录因子CsYABBY3。功能验证表明，该因子不仅能促进腺毛的分化，还能显著提升CBD和CBG等主要大麻素的积累。研究通过DAP-seq全基因组结合位点分析，共鉴定出3154个CsYABBY3结合峰，其中约12.4%位于基因转录起始位点上游2kb的启动子区域，并鉴定到显著富集的核心结合基序TAATTAA。
2026-05-12 14:33:05
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原创 组学数据必备！KEGG富集分析超详细解读，零基础也能看懂
KEGG富集分析，就是把我们筛选出的差异基因/差异代谢物，映射到KEGG数据库的各个生物学通路中，统计哪些通路被显著富集，从而判断这些差异分子主要参与哪些生命活动、调控哪些生物学过程。
2026-05-12 14:26:39
885
原创 New Phytol（IF=8.1）▏DAP-seq技术助力揭示水稻免疫调控分子机制
该研究利用RNA-seq比较onac122、onac131突变体、过表达株系与野生型的转录组差异，GO与KEGG富集分析表明，相关差异表达基因主要富集在植物-病原菌互作、MAPK 信号通路等免疫相关通路。
2026-05-12 13:29:48
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原创 连发Cell/Science/Molecular Plant，DAP-seq如何成为植物功能基因研究关键技术？
在植物科学研究中，解析转录因子与DNA的特异性互作，是构建基因表达调控网络、揭示生命活动分子机制的关键环节。传统ChIP-seq技术因依赖目的蛋白特异性抗体，成为非模式植物研究的重要瓶颈。DAP-seq技术无需特异性抗体和转基因材料，可全基因组鉴定转录因子结合位点，为模式/非模式生物研究提供高效方案。
2026-04-30 10:41:59
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原创 JIPB（IF=9..3）▏DAP-seq技术助力揭示低氮胁迫下毛白杨木材形成的分子调控机制
过表达株系与野生型（WT）杨树的差异显著表达基因（SDEGs）数量，以及低氮（LN）与正常氮处理的野生型杨树间的差异显著表达基因数量。转基因植株与野生型植株茎的木质部宽度（E）、木质部/茎横截面积比（F）、导管频率（G）、导管管腔面积（H）及双纤维细胞壁厚度（I）。转基因及野生型杨树茎的木质部宽度（E）、木质部/茎横截面积比（F）、导管频率（G）、导管管腔面积（H）及双纤维细胞壁厚度（I）。C）与正常氮供应的野生型杨树相比，两组对比中共同参与木质素生物合成且呈同步上调或下调的差异显著表达基因的表达水平。
2026-04-17 15:30:01
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原创 韦恩图在线绘图工具
韦恩（Venn）图是常见统计图之一，也是科研文章中最常见展示形式之一。主要用于展示各样本（或分组）之间共有（或特有）元素的数量（或比例）。用来描绘多个数据集之间的关系。
2026-04-17 15:17:46
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原创 Science Advances（IF=12.5）| DAP-seq助力揭示血吸虫雌虫性成熟的分子调控机制
本研究解析了BATT调控雌性生殖成熟的分子机制，发现转录因子znf362的长异构体znf362.1是BATT诱导雌性卵巢和卵黄腺成熟的下游关键调控因子，该因子在BATT处理后，于卵巢卵母细胞和卵黄腺S1细胞中特异性上调，且仅调控生殖干细胞的分化过程，不影响其增殖。
2026-04-16 11:54:46
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原创 Horticulture Research（IF = 8.5）▏DAP-seq技术助力揭示MeJA缓解桃果实冷害的分子机制
作为典型的跃变型果实，因风味佳、营养丰富占据重要市场地位，但采后冷藏易引发冷害（CI），表现为表面凹陷、内部褐变（IB）、成熟受阻等症状，其中内部褐变主要由酚类物质的酶促氧化导致，严重降低果实商品性。茉莉酸甲酯（MeJA）作为植物信号分子，已被证实可增强多种果实的耐冷性，其作用与乙烯合成、抗氧化能力提升等生理过程相关，但MeJA介导桃果实耐冷性的分子机制，尤其是关键转录因子MYC2的调控网络及JAZ蛋白的调控作用，尚未明确。图4 PpMYC2.1介导的桃果实乙烯合成相关关键转录因子（TFs）的直接调控。
2026-04-03 16:58:27
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原创 Hortic. Plant J（IF=6.2）| DAP-seq和RNA-seq联合助力揭示SmBBX22调控茄子花青素合成的分子机制
该研究通过DAP-seq与RNA-seq技术联合分析，成功鉴定出SmBBX22的下游靶基因，明确其通过调控苯丙烷类和黄酮类生物合成通路正向调控茄子花青素合成的分子机制，不仅填补了茄子SmBBX基因家族调控机制的研究空白，更为作物品质改良提供了关键分子靶点。基因在茄子不同发育阶段的功能作用，研究团队通过RNA-seq分析，鉴定出不表达、组成型表达和组织特异性表达三种模式，其中3个基因全程不表达，8个基因在各组织/器官中组成型高表达（如。以上结果共同证实，SmBBX22是茄子花青素生物合成的关键调控因子。
2026-04-03 16:37:51
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