采用igraph包分析网络数据

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对于网络的可视化和数据挖掘，有很多图形界面的软件可供选择，比如cytoscape, gephi 等等，这些软件使用方便，操作简单，功能的强大，但是同时也有着一个缺点，就是无法自动处理，只能通过人工点击鼠标来操作，对于大批量数据的分析而言，依靠人工费事费力。

为了能够自动化编程处理，有很多的程序被开发出来，专门用于网络数据的可视化和分析，igraph就是其中的佼佼者。igraph是一个开源项目，旨在提供一个简单易用，功能强大的网络数据处理框架，在R，Python, C语言中都有具体实现，网址如下

http://igraph.org/

本篇以R语言为例，展示其用法。在R语言中，对应的包名为igraph, 安装方式如下

install.packages("igraph")

network对应的数据结构为graph, 通常用大写字母G表示，顶点的英文为vertex, 用大写字母V表示，边的英文为edge, 用大写字母E表示。对于igraph而言，常用的操作包括以下几种

1. 在R中创建一个network

创建network有很多种方式，这里我们只展示最常用的一种，从文件中读取节点和边的信息，然后在R中创建一个network, 对于节点而言，文件内容示例如下