genome repeat sequence | 基因组重复序列

本文介绍了如何从带有softmasking的小写字母基因组序列中提取重复序列,并将其保存为Bed文件格式。softmasking是一种标记基因组中重复区域的方法。

基因组里的小写字母的序列就是soft masking,也就是被标记的重复序列。

怎么把重复序列提取出来,保存为bed文件?

 

参考:Uppercase vs lowercase letters in reference genome

 

转载于:https://www.cnblogs.com/leezx/p/8647870.html

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