- 博客(18)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 R2R3-MYBs 的结构保守性
在我们之前的研究中，我们在整个植物界中发现了12种高度保守的内含子模式[10]，这些模式可能在从水生向陆生植物过渡的早期就出现了，这是基于保守的内含子数量、插入位置和内含子相位（补充图1）。在测试的R2R3-MYB中，大约70%的成员共享这12种内含子模式中的三种类型（模式a、b和c）[10]，这表明在进化过程中存在有偏的扩张。最近的一项研究表明，一些轮藻的R2R3-MYB的内含子-外显子结构与其同一亚家族中相应的陆生同源物完全相同，而其他一些则显示出明显的差异，这表明祖先基因之间存在差异[6]。
2025-04-17 14:59:54
720
原创 芸苔属植物中长末端重复序列反转录转座子爆发的独立和多轮热点区域
ORF由gag、天冬氨酸蛋白酶（AP）、整合酶（INT）、逆转录酶（RT）和RNase H（RH）组成（Wicker et al., 2007）。本研究于2017年冬季进行，使用了三种二倍体（甘蓝型油菜（B. rapa）、黑芥（B. nigra）和甘蓝（B. oleracea））和两种四倍体（甘蓝型油菜（B. napus）和芥菜（B. juncea））芸苔属植物的基因组，以及萝卜（R. sativus）基因组，因为萝卜与芸苔属植物在进化上关系密切（Zhang et al., 2015;
2025-03-19 17:18:23
577
原创 基因组组装和重测序分析为紫薇的进化、驯化及观赏性状提供了新的见解
L. indicaL. indicaL. indicaL. indicaandL. faurieiL. indicaCDL15CRG98, andGID1b1L. indicaL. indicaMYB35NCED, andKAS1L. indica摘要紫薇（）是一种全球广泛应用的观赏木本植物，也是千屈菜属（）的代表物种。然而，由于缺乏参考基因组，对L. indica的进化和基因组育种研究受到了限制。
2025-03-19 15:30:21
617
原创 R2R3-MYB转录因子GaPC调控棉花花瓣着色
GaPCGossypiumarboreumGaPCGaPCleads to aGapcGaPCGaPCGaPCandflavoneflavonoidsGaPC摘要尽管在植物中已经报道了一些基因表观遗传的案例，但基因型表型分离与相关分子机制的联合分析仍然是一个较少研究的领域。在本研究中，我们鉴定了一个控制棉花 () 花瓣着色的基因（命名为 GaPC），并发现其遵循可遗传的隐性表观遗传遗传模型。花瓣着色由单一的显性基因 GaPC 控制。
2025-03-14 21:07:56
593
原创 无间隙基因组组装揭示杜鹃花基因组及其与花色分化相关的多组学研究
The genusGypsyR. molleR simsii杜鹃花属（Rhododendron，杜鹃花科）包含1000多个物种，其花色高度多样化，不仅具有独特的观赏价值，还为花色研究提供了理想的模型系统。本研究以两种常用于杜鹃花育种且花色不同的亲本物种为研究对象，探究了它们之间的分化机制。我们对开黄花的杜鹃花物种——羊踯躅（Rhododendron molle）进行了无间隙基因组组装。
2025-03-14 20:28:34
599
原创 《蒙古沙冬青的参考级基因组揭示了其在豆科植物中的进化历史和耐旱机制》
AmERF2生长在极端环境中的植物是独特抗逆基因和机制的来源。蒙古沙冬青（*Ammopiptanthus mongolicus*，豆科）是一种原产于半干旱和沙漠地区的旱生常绿阔叶灌木；然而，其耐旱机制尚未被充分理解。在此，我们报告了蒙古沙冬青的参考级基因组组装，描述了其在豆科中的进化历史，并研究了其耐旱机制。组装的基因组长度为843.07 Mb，其中98.7%的序列成功锚定到蒙古沙冬青的九条染色体上。
2025-03-03 16:05:31
1046
原创 《马蔺（Astragalus sinicus）染色体级基因组组装及比较基因组分析为理解豆科植物与根瘤菌的相互作用提供了新的资源和见解》
基于重复基因对的四重同义第三密码子颠换（4DTv）率，CMV 显示出两个峰值，一个在 0.6 左右，对应于双子叶植物物种共享的 γ 多倍体化事件，另一个在 0.2 到 0.4 之间，与 Papilionoideae 亚科物种共享的全基因组重复（WGD）事件一致（Li et al., 2013；为了研究 CMV 的进化历史，我们分析了 19 个已测序的豆科物种和一个外群物种阿拉伯芥（Arabidopsis thaliana）的基因组（Kim et al., 2010；
2025-02-27 17:28:57
883
原创 《Agave hybrid NO.11648 的染色体级基因组组装为 CAM 光合作用提供了新见解》
50A. hybridPEPCKPEPCKgenes (andPEPCK12PEPCK3Agavespp.摘要Agavoideae 亚科包括了具有景天酸代谢（CAM）、C3 和 C4 光合作用类型的植物，且其物种形成较年轻，突变积累较慢，使其成为研究 CAM 进化的典型作物。然而，由于缺乏基因组信息，CAM 进化的遗传机制仍不明确。
2025-02-27 17:03:35
627
原创 西藏沙棘染色体水平基因组组装揭示了高海拔适应和类黄酮生物合成的机制
Chromosome-level genome assembly of Hippophae tibetana provides insights into high-altitude adaptation and flavonoid biosynthesisAs an endemic shrub of the Qinghai-Tibetan Plateau (QTP), the distribution of Hippophae tibetana Schlecht. ranges between 2800
2025-02-26 17:23:40
847
原创 文章合集呀
Gene duplication and evolution in recurring polyploidization–diploidization cycles in plants
2025-02-26 16:00:52
131
原创 桂花的全基因组重测序为花色进化提供了见解
Osmanthus fragrans is a well-known ornamental plant that has been domesticated in China for 2500 years. More than 160 cultivars have been found during this long period of domestication, and they have subsequently been divided into four cultivar groups, inc
2025-02-19 16:57:54
993
原创 转录组和化学分析揭示了Rosa Rugosa中花色形成的机制
Rosa rugosa is a famous Chinese traditional flower with high ornamental value and well environmental adapt ability. The cultivation of new colorful germplasms to improve monotonous flower color could promote its landscape application. However, the mechanis
2025-02-18 15:07:58
375
原创 兰花花色苷合成相关R2R3-MYB基因的全基因组鉴定与分析
其中，66个（63%）CgMYB基因包含3个外显子，20个（19%）包含2个外显子，8个基因包含4个外显子，仅有6个基因包含超过4个外显子。超过一半（59%）的基因通过2个内含子和3个外显子进行剪接，而18个CgMYB基因包含1个内含子和2个外显子，其余基因的内含子数量在3到12个之间。尽管内含子和外显子的长度并不一致，但它们的数量分布表明，同一亚家族的基因序列结构高度相似。例如，S1亚家族的模式为2个内含子和3个外显子，而S4亚家族的模式为2个内含子和3个外显子或1个内含子和2个外显子。
2025-02-14 15:22:53
784
原创 重测序和转录组分析揭示了核桃（ Juglans regia L.）花青素生物合成相关葡萄糖基转移酶基因的差异表达模式和序列变异
L.)Abstract 抽象的JrUFGT53-OJrUFGT5JrUFGT5O核桃青皮的颜色通常在发育阶段为绿色，是核桃果实外观质量的重要特征之一。红色核桃‘RW-1’因其青皮中花青素的积累而呈现红色，是一种特异的种质资源，但其机制尚不清楚。本研究通过重测序和转录组分析，研究了不同颜色核桃青皮中花青素积累的差异。在‘中林1号’和‘RW-1’之间共检测到2,696,620个SNP和495,238个InDel，其遗传关系比它们与核桃参考基因组‘Chandler’的关系更为密切。
2025-01-14 15:13:19
563
原创 Genetic and multi-omics analyses reveal BnaA07.PAP2In-184-317 as the key gene conferring anthocyanin
B. napusBnaMYBL2, andBnaTT8In-184-317B. napus油菜花朵基于花青素的颜色分子机制仍未明了。为了鉴定与杏色和粉色花朵颜色相关的关键基因和代谢物，研究者对杏色、粉色、黄色和白色花朵的油菜F2群体进行了代谢组学、BSA-seq和RNA-seq分析。杏色花瓣中富含黄色类胡萝卜素和红色花青素，而粉色花瓣中积累了无色类胡萝卜素和红色花青素。大多数类胡萝卜素基因在杏色与黄色花瓣、粉色与白色花瓣之间未表现出差异调控。
2025-01-10 19:41:30
801
原创 Multi-Omics Analysis Revealed the AGR-FC.C3 Locus of Brassica napus as a Novel Candidate for Control
油菜（Brassica napus）花瓣颜色的变异对其观赏价值至关重要，但控制该性状的基因座尚未完全揭示。本研究通过对具有不同花瓣颜色的分离群体进行集群分离分析，报告了一个候选基因座AGR-FC.C3。结果表明，该基因座覆盖了9.46 Mb的基因组区域，包含951个基因。我们观察到MYB转录因子家族中的BnaC03.MYB4、BnaC03.MYB85、BnaC03.MYB73、BnaC03.MYB98和BnaC03.MYB102等基因，可能调控花瓣颜色。
2025-01-09 21:26:38
656
原创 BSA-seq、BSR-seq 和 RNA-seq 的关联分析揭示了茶群体（Camellia sinensis）中紫叶形成所涉及的关键基因
Abstract 抽象的FCHSF3HANSMYB75GSTMATE, andABCC,CsANSandCsMYB75CsMYB75CsMYB75紫茶富含花青素，具有多种健康益处，正在吸引全球的关注。然而，紫茶群体中花青素的调控机制尚未得到广泛研究。在本实验中，使用“紫鹃”和“锦轩”F 1 群体中的 30 个具有极端颜色（深紫色和绿色）的个体进行 RNA-seq、BSA-seq 和 BSR-seq。
2025-01-04 15:43:10
955
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人