29、基于文献的发现：原理、工具与趋势

基于文献的发现：原理、工具与趋势

1. 基于文献的发现概述

基于文献的发现（LBD）是一系列以科学文献为输入，运用计算、手动或混合处理流程，最终生成具有潜在新颖性和研究价值假设的方法。其起源可追溯到Swanson的开创性工作，后续发展中出现了多种工具和资源，也呈现出不同的发展趋势。

2. Swanson的开创性工作

2.1 未发现公共知识的挖掘问题

Swanson以雷诺病与鱼油的发现为例，阐述了从生物医学文献中挖掘未发现公共知识的问题。当独立创建的知识片段在逻辑上相关，但从未被一起检索、解读和研究时，这些知识虽然公开却未被发现。两个互补且不直接交互的文献集合结合起来，可能揭示出单独一个集合中不明显的科学信息。

2.2 Swanson的UPK模型

Swanson将从生物医学文献中发现未发现公共知识（UPK）的过程形式化。考虑两个独立的文献集合CL和AL，CL中的文献讨论概念C，AL中的文献讨论概念A，它们都与一些中间概念B（桥接概念）相关，但两个文献集合中都未共同讨论通过概念B建立的A与C的联系。Swanson的UPK（或ABC）模型是从“A意味着B”和“B意味着C”推导出“A意味着C”，但这种推导的知识或关系是假设性的。

2.3 雷诺病与鱼油的发现实例

Swanson通过分析讨论雷诺病的文献集，发现雷诺病（C）是一种外周循环障碍，会因高血小板聚集（B）、高血液粘度（B）和血管收缩（B）而加重。然后他针对这些概念在MEDLINE中搜索相关文献集，发现摄入鱼油（A）可以减少这些现象（B），但两个文献集中都没有文章同时提及雷诺病（C）和鱼油（A）。因此，Swanson假设