蛋白质表面分析与胎儿颈部透明带测量的创新方法
在生物信息学和医学超声影像分析领域,蛋白质表面分析以及胎儿颈部透明带(NT)厚度测量是两个重要的研究方向。前者对于理解蛋白质相互作用至关重要,后者则在孕期染色体缺陷筛查中发挥着关键作用。下面将详细介绍这两个领域的相关研究方法和实验结果。
蛋白质表面分析方法
在蛋白质表面分析中,为了从轮廓点扩展到边界线进行分析,研究人员提出了两种方法,并对它们的性能进行了比较。
1. 基于热扩散过程模拟的标记方法
该方法将蛋白质的数字体积视为由热方程支配的各向同性固体金属。热方程是一个偏微分方程,用于确定蛋白质表面的凹凸性,热代表凸,冷代表凹。
热方程:
[
\frac{\partial u}{\partial t} = k\left[\frac{\partial^2 u}{\partial x^2} + \frac{\partial^2 u}{\partial y^2}\right]
]
其中,$k$为扩散系数。
具体操作步骤如下:
- 初始化 :给对象的所有边界点赋予一个常数值,对象内部赋值为零。
- 扩散过程模拟 :执行有限序列的各向同性绝热三维扩散过程,向对象内部进行扩散。为了模拟离散的热扩散过程,将上述热方程转换为差分方程:
[
u_{t + 1}(p) = u_t(p) + k\left[\sum_{q \in N_1}(u_t(p) - u_t(q)) + \sum_{q \in N_2}\frac{1}{\sqrt{2}}(u_t
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