15、微阵列数据管理：全面解析与实践指南

微阵列数据管理：全面解析与实践指南

1. 微阵列实验相关基础要点

微阵列实验涉及杂交、测量和归一化等关键步骤。MIAME 指南为特定类型实验的标准化提供了蓝图，其更新摘要可在 MGED 协会网站获取。MIAME - Tox 则涵盖了毒理基因组学和药物基因组学研究中细胞类型、解剖学术语、组织病理学、毒理学和化合物命名等描述符。

2. 数据库管理系统（DBMS）

微阵列数据的存储、探索和交换需要强大的计算机系统，数据库管理系统（DBMS）应运而生。常见的 DBMS 产品有 Oracle、Sybase、DB2 和 MySQL 等。使用 DBMS 有诸多好处，如安全访问已发表和未发表的数据、消除冗余和不一致信息、可靠的数据存储和检索、数据溯源以及历史恢复等。

DBMS 不仅可存储原始数据，还能存储元数据。元数据可分为以下两类：
- 技术元数据 ：主要用于支持部署和实施特定 DBMS 的工作人员，描述数据库的物理组织、访问策略、用户账户和完整性约束等。
- 微阵列元数据 ：使用 MIAME 和 GO 标准进行注释的数据，包括 MO 的使用。

数据存储在 DBMS 中需遵循数据模型的规则。常见用于交换微阵列信息的数据模型有三种，下面详细介绍。

3. 关系数据模型（R - DM）

关系数据模型由 Codd 在 1970 年提出，其核心是将数据以二维表形式呈现。表由行（元组）和列（属性）组成，每个表有唯一的主键来标识元组，通过匹配主键值建立表间关系。外键允许关联多个由模式定义的表，模式常指数据库结构的图形化描述，定