Circos图入门简介 -- 优雅的展示复杂生物数据

最新推荐文章于 2025-01-20 13:54:00 发布

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分类专栏：其他文章标签： ciscos 生物信息

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/sscc_learning/article/details/73249944

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Circos是一款用Perl编写的用于基因组数据可视化的免费软件，以其独特的图形结构展示复杂生物信息。尽管其丰富的展示方式和强大功能使其在数据可视化方面具有优势，但学习曲线较陡峭，需要通过配置文件进行操作。本文介绍了Circos的安装、运行、软件原理和图形结构，包括染色体设置和其他图形元素，如点、线和热图，帮助读者初步了解如何利用Circos优雅地展示生物数据。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

本文中所展示的Circos图片均来自circos官方网站(http://circos.ca/)
Circos 是使用Perl语言编写与运行的免费软件。它可以轻易地根据纯文本的配置文件，将用户的输入数据转化为像素图片(PNG)或矢量图片(SVG)。
Circos俗称“圈图”，可应用于多种场景。本文主要介绍其最常用也是最主要的应用——基因组数据展示。

Martin Krzywinski 最早开发了Circos，他不仅是一名生物信息科学家，同时也是一位优秀的专业摄影师。科学与艺术的双重造诣使得 Circos 不仅具备完善的数据可视化功能，优美的展示方式也是Circos的一大特色。

强大的功能，丰富展示方式虽是Circos相较于其他软件的优点，但也它的缺点，因为这使它比其他软件更难于上手。另外，软件没有的可视化操作界面，只能在DOS等命令窗口中以执行代码的形式作图。加上配置文件中令人眼花缭乱的参数设置，想灵活的使用并做出一幅优秀的作品需要不断地练习。今天将为您揭开它神秘的面纱，从软件安装、软件原理和图形结构三方面为大家简单介绍这款强大的可视化软件，让大家有初步的了解。

更多强大的功能，请查看circos官方教程 - http://circos.ca/intro/tabular_visualization/。