python画circos图_Circos图--在线绘制

相信大家都听说过circos图，但是亲自画过的人可能就很少，这主要因为软件的安装和使用稍微有一点麻烦。其实，circos图也是可以在线绘制的，这样就简单多了！一起来了解一下吧！

在circos官网(http://circos.ca/)的最右方有个“CIRCOS ONLINE”选项，这里可以实现在线绘制部分circos图。

打开后界面如下：

以微生物多样性分析中样品与物种丰度circos图绘制为例，给大家讲解circos图的绘制功能。该图能够很直观的反映各样品中不同物种所占的比例，以及物种在不同分组或者样品中的分布关系。

绘制circos图

1.数据准备

首先我们要做的就是准备画图所用到的数据，所用数据为物种在各样品中的相对丰度，这里只选用丰度大于0.01的物种用于绘图，数据如下(列名A、B、C为样品，行名Acetobacteraceae等是科一水平的物种分类)：OTU    A       B       C

Acetobacteraceae        0.506365321669611       0.596887241236994       0.457528142134733

Arcobacteraceae 0.000329490484604467    0.017913387252098       0.000426249200782749

Bacteroidaceae  0.0175209280769342      0.0455871811395347      0.352