25、临床领域的元数据、语义和本体建模

临床领域的元数据、语义和本体建模

在临床数据管理和整合中，即使局部本体与参考本体不完全对齐，也很可能在它们之间建立部分映射，以支持整合任务。通常，建立全球资源是社区共同努力的结果，促进了局部和全球层面建模经验的有益融合。

1. 临床领域的建模问题

临床特征给本体设计带来了特定的问题，这里主要关注与临床实践和研究相关的方面，而不涉及管理、行政和普查等方面。

临床指标是指任何与临床相关的患者特征，在计算上表现为健康记录的一个字段。“指标”这一术语比“数据”更合适，因为它并不预先暗示计算表示。对临床指标的评估有助于逐步刻画患者的临床状态。然而，仅对临床指标进行建模并不能明确表示为什么要评估这些指标，以及它们在定义临床状态时的相互关系，或者它们与生物医学研究的关系。

1.1 临床指标建模

临床指标可以涉及患者的不同方面，以下是一些具有代表性但并非详尽无遗的例子：
- 个人身份信息：如姓名、社会保险号码。
- 人口统计学信息：如年龄、教育程度、种族。
- 生活方式：如饮食、吸烟、饮酒情况。
- 基本常用生物特征：如体重、身高。
- 生命体征参数：如体温、血压、脉搏。
- 体征：由医生通过直接检查患者评估得出，如面色苍白、淋巴结肿大。
- 症状：由患者自行报告，如头痛、意识模糊。
- 实验室检查：通常在样本上进行，可进一步分为基因、生化、生物分子、细胞、组织学等类别，如血红蛋白水平、血常规、血型。
- 仪器记录：如心电图。
- 影像学检查：如磁共振成像（MRI）。
- 专家报告：对仪器记录或影像学检查进行进一步分析，通常用自然语言表述，如放