超好理解的广义线性混合模型

广义线性混合模型介绍

1. 广义线性模型(GLM)概述

在介绍GLMM之前,我们需要先回顾一下广义线性模型(GLM)的基本概念。广义线性模型是对经典线性回归模型的推广,适用于非正态分布的数据。GLM由以下三个主要组成部分构成:

4a6643413cf44338ba6918a44cb97e57.png

2. 混合效应模型

混合效应模型(Mixed Effects Model)是一种包含固定效应随机效应的模型:

  • 固定效应(Fixed Effects):这些效应通常是我们关心的主要效应,比如实验中的处理效应、性别、年龄等,这些因素在整个样本中被认为是相同的。
  • 随机效应(Random Effects):这些效应通常用于捕捉数据中不同层级(如个体、组、学校等)之间的变异,随机效应在不同层次(如不同个体或组)之间变化,通常认为是从某个分布(如正态分布)中随机抽取的。

混合效应模型的一个重要特征是能够处理数据中的层级结构(例如,学生嵌套在班级中、病人嵌套在医院中等),并且考虑了这些层级之间的相关性。

3. 广义线性混合模型(GLMM)

广义线性混合模型结合了广义线性模型混合效应模型,它允许响应变量服从任何符合广义线性模型设定的分布(如二项分布、泊松分布等),并且能够考虑数据中的固定效应和随机效应。GLMM的基本结构可以描述为:

f5e3a8a1ca354dd79f0342f49b44b00d.png

4. GLMM的组件

GLMM由以下几个重要组件构成:

fd4fc78185a34d89bd5198960e4dafa3.png


代码

1. 拟合混合效应模型:

fit33 <- glmer(response.x ~ RT.mean + CURRENT_FIX_DURATION.mean +
               fixatype + sm + fixacount + (1 | sub), data = ic, family = "binomial")
  • glmer()
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