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推荐大家购买最新的教程，若是已经购买以前WGNCA教程的同学，可以在对应教程留言，即可获得最新的教程。（注：此教程也仅基于自己理解，不仅局限于此，难免有不恰当地方，请结合自己需求，进行改动。，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!**：以上仅代表个人学习笔记，若有错误的部分，请指正！

小杜的生信筆記 ，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!

推荐大家购买最新的教程，若是已经购买以前WGNCA教程的同学，可以在对应教程留言，即可获得最新的教程。（注：此教程也仅基于自己理解，不仅局限于此，难免有不恰当地方，请结合自己需求，进行改动。包，在前面的教程分享过。，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；批量做差异分析及图形绘制 | 基于DESeq2差异分析。转录组上游分析教程[零基础]此教程，我们分享使用。3. 转录组分析教程。

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ggplot2绘制多组热图

ggplot绘制多组热图

系统发育树绘制教程

科研绘图教程推荐

科研绘图

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推荐大家购买最新的教程，若是已经购买以前WGNCA教程的同学，可以在对应教程留言，即可获得最新的教程。（注：此教程也仅基于自己理解，不仅局限于此，难免有不恰当地方，请结合自己需求，进行改动。也许，在看推文的你也在写工作总结，一年时间一转眼就是一年，过得不知不觉........，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；也许，2024，你完成了你的人生大事中的一件、两件、三件.....；也许，2024，你已经硕、博毕业，进入工作；也许，2024，你考上了理想的学校；

使用conda管理R语言，安装包，与传承的方式不一样。

copilot类似于open AI，可以自动给你撰写R代码，以及根据你的提示给你可能想要的分析。到这里，你在Rstuido中的设置就已经结束，现在需要注册copilot账号。OK，今天的教程到这里就结束了，很多Copilot的玩法等你来探索。但是，也有可能是网络的问题，那么你就需要进行。在解决R中的问题，是比较好用的。

获得本期教程全文代码：在订阅号后台回复关键词：20240923。

表棒棒图绘制教程，基于R 语言

棒棒图绘制教程

对于维恩图的绘制教程，我们在前面分享过基于R语言绘制VennPlot图 | 可以绘制大于等于7个类别的码。但是，随着使用的R包的升级，我们绘制的维恩图会出现不显示数值的情况。因此，这个教程的码，若是不做修改的话，就不能使用。维恩图是我们日常分析中常用到的图形，使用的频率非常高（包括自己）。因此，我们今天再分享一篇制作维恩图的教程。此教程使用的R包也是很简单，内容非常丰富。

维恩图绘制教程

维恩图绘制教程

8月份，我们一共更新了16个教程，上半个月文本教程相对占的比例较高（PS：这段时间在捣鼓这些内容），下旬时间绘图教程分享的比例较高。有些属于个人随笔的推文，我们的就没有统计上去，自己在本地也没有保存这些文档。，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。

8月份，我们一共更新了16个教程，上半个月文本教程相对占的比例较高（PS：这段时间在捣鼓这些内容），下旬时间绘图教程分享的比例较高。有些属于个人随笔的推文，我们的就没有统计上去，自己在本地也没有保存这些文档。，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!若我们的教程对你有所帮助，请。，这是对我们最大的支持。

下载组学数据一般为SRA文件格式，需要将其拆分为FQ文件格式，常用的工具是NCBI中的fastq-dump软件进行拆分。，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；由于微信改版，一直有同学反映。：若你有好的教程或想法，可添加小杜个人微信。软件只能使用单线程运行，速度非常慢。工具，实现多线程运行，提供工作效率。，但支持小问题2-3个免费咨询。欢迎关注《小杜的生信笔记》！若我们的教程对你有所帮助，请。，不错过每一条推文教程。，这是对我们最大的支持。下载后解压，操作上同。

誰能经得住几个3年，3年可以硕士毕业；3年可以从硕到博；3年可以让你从一个刚出炉的“小白”到身经百战的“大You”；3年可以生个小孩，小孩也快2岁了，也可是3岁；3年真的可以做很多事。但，3年，在我们这里最大的看点就是文章内容变多了。

从很早关注我的同学应该了解小杜的知识分享历程，小杜是从2021年11月底开始进入此“坑”，一直坚持到现在，马上3年了（24年11月底到期）。自己也从一个小青年，变成一个大青年。也许后面，会一直更新下去，但是也许我某一天突然间就停止。誰能经得住几个3年，3年可以硕士毕业；3年可以从硕到博；3年可以让你从一个刚出炉的“小白”到身经百战的“大You”；3年可以生个小孩，小孩也快2岁了，也可是3岁；3年真的可以做很多事。但，3年，在我们这里最大的看点就是文章内容变多了。

关于**《R语言绘图专栏》**，此专栏基于R语言绘制图形。每个图形我们会提供对应的R代码数据和文本文档。此系列将会是一个长期更新的系列。本系列教程，我们计划发表及收录使用R语言绘制。这是个长期的过程，计划花费3-4个的时间完成。

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R语言绘图，ComplexUpset图绘制教程

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我们在前面的教程分享了模式植物构建orgDb数据库 | 以org.Slycompersicum.eg.db为例,这两天也做对应的分析，但是发现前面的代码速度太慢了，以及会出现报错的情况。那么我们也做了对应的优化，可以大大减少花费时间，以及减少我们的报错。现在我们的代码，可以直接读取eggnog分析获得数据，非常的方便。此外，我们在这里依旧推荐大家使用本地的Egg-mapper进行注释，我自己使用下来，非常的快捷。

我们的代码可能在运行时候会出现不同的问题，也会出现，在我这里正常运行，而在你那边程序中却报错的情况。虽然网页版的Egg-mapper工具，现在可以支持最多10000条的序列，但是速度依旧是比较慢的。好比，这个教程，我昨天的运行时，也各种报错，内心是发狂的，不知道为什么。自己的代码或教程，在前面分析过程中可以运行，但是现在再去使用时也会报错。,这两天也做对应的分析，但是发现前面的代码速度太慢了，以及会出现报错的情况。那么我们也做了对应的优化，可以大大减少花费时间，以及减少我们的报错。，这是对我们最大的支持。

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