8、深入理解MCMC算法:原理、诊断与实用技巧

深入理解MCMC算法:原理、诊断与实用技巧

1. 不要混合后验样本

在MCMC过程中,我们会得到代表未知后验样本的向量。不同向量的元素不能混合使用,因为这会破坏逻辑。例如,在聚类问题中,两个聚类的标准差是相互依赖的。如果一个聚类的标准差小,另一个聚类的标准差大概率就大。所有的未知变量都以类似的方式相互关联,如标准差大时,均值的可能取值范围更广;标准差小时,均值的取值范围则会受限。

为避免这个问题,要确保正确索引轨迹。下面通过一个简单例子说明:

import pymc as pm
x = pm.Normal("x", 4, 10)
y = pm.Lambda("y", lambda x=x: 10 - x, trace=True)
ex_mcmc = pm.MCMC(pm.Model([x, y]))
ex_mcmc.sample(500)

在这个例子中, x y 是相关的( x + y = 10 )。如果将 x 的第 i 个样本和 y 的第 j 个样本相加( i != j ),这是错误的做法。

2. 聚类预测

前面的聚类可以推广到 k 个聚类。当有新的数据点(如 x = 175 )需要标记到某个聚类时,不能简单地将其分配给最近的聚类中心,因

复杂几何的多球近似MATLAB类及多球模型的比较 MATLAB类Approxi提供了一个框架,用于使用具有迭代缩放的聚集球体模型来近似解剖体积模型,以适应目标体积和模型比较。专为骨科、生物力学和计算几何应用而开发。 MATLAB class for multi-sphere approximation of complex geometries and comparison of multi-sphere models 主要特点: 球体模型生成 1.多球体模型生成:Sihaeri的聚集球体算法的接口 2.音量缩放 基于体素的球体模型和参考几何体的交集。 迭代缩放球体模型以匹配目标体积。 3.模型比较:不同模型体素占用率的频率分析(多个评分指标) 4.几何分析:原始曲面模型和球体模型之间的顶点到最近邻距离映射(带颜色编码结果)。 如何使用: 1.代码结构:Approxi类可以集成到相应的主脚本中。代码的关键部分被提取到单独的函数中以供重用。 2.导入:将STL(或网格)导入MATLAB,并确保所需的函数,如DEM clusteredSphere(populateSpheres)和inpolyhedron,已添加到MATLAB路径中 3.生成多球体模型:使用DEM clusteredSphere方法从输入网格创建多球体模型 4.运行体积交点:计算多球体模型和参考几何体之间的基于体素的交点,并调整多球体模型以匹配目标体积 5.比较和可视化模型:比较多个多球体模型的体素频率,并计算多球体模型原始表面模型之间的距离,以进行2D/3D可视化 使用案例: 骨科和生物力学体积建模 复杂结构的多球模型形状近似 基于体素拟合度量的模型选择 基于距离的患者特定几何形状和近似值分析 优点: 复杂几何的多球体模型 可扩展模型(基于体素)-自动调整到目标体积 可视化就绪输出(距离图)
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