Science | 炎症性肠病和肠易激综合征肠道微生物组组成及功能变化

最新推荐文章于 2024-02-21 07:02:20 发布

Deepgener

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分类专栏：编辑知识深度基因生物信息生物医学肠道菌群文章标签：炎症性肠病肠易激综合征肠道菌群 16SRNA Shotgun Mategenomic sequencing

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/deepgener/article/details/85301599

研究使用shotgun metagenomic sequencing分析了1792名炎症性肠病（IBD）和肠易激综合征（IBS）患者的粪便样本，发现两者肠道微生物组有显著差异。尽管两者之间存在重叠，但通过微生物组组成可区分IBD和IBS。研究还揭示了与疾病相关的细菌生长动态、功能变化和毒力因子，提出微生物组可能是区分这两种疾病的潜在预测因子。此外，疾病特异性因素如疾病活动度、手术史等对微生物组的影响也得到了关注。

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炎症性肠病和肠易激综合征肠道微生物组组成及功能变化

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文献导读

炎症性肠病是一组特定的肠道慢性疾病的统称，主要包括克罗恩病和溃疡性结肠炎—维基百科
肠易激综合征是一组持续或间歇发作，以腹痛，腹胀，排便习惯或大便性状改变为临床表现，而缺乏胃肠道结构和生化异常的肠道功能紊乱性疾病—百度百科

文献信息

英文标题：Gut microbiota composition and functional changes in inflammatory bowel disease and irritable bowel syndrome
中文标题：炎症性肠病和肠易激综合征肠道微生物组组成及功能变化
作者信息：Arnau Vich Vila(第一作者)，Rinse. K Weersma(通信作者): Email：r.k.weersma@umcg.nl
通信地址：University of Groningen and University Medical Center Groningen, Department of Gastroenterology and Hematology, Groningen, Netherlands.
影响因子：16.71 PMID: 30567928 期刊年卷：Sci Transl Med 2018 Dec 19;10(472)
DOI:10.1126/scitranslmed.aap8914
注：本文章所有图片均在链接里面，想要详细解读图表者建议打开文章最下方链接

文献摘要

肠道微生物组的变化与两种最常见的胃肠疾病，炎症性肠病（IBD）和肠易激综合征（IBS）有关。这篇文献中，作者使用shotgun metagenomic sequencing对1792名患有IBD和IBS的个体的粪便样品进行病例对照分析。与对照个体相比，虽然IBD和IBS患者的肠道微生物组之间存在大量重叠，但是通过肠道微生物组组成差异可区分患有IBD的患者和患有IBS的患者。通过将物种水平分布和菌株水平分布与细菌生长速率，代谢功能，抗生素抗性和毒力因子分析相结合，从而确定可能与两种常见胃肠道疾病有关的关键细菌种类。对三个表型良好的荷兰队列的粪便样本进行了shotgun metagenomic sequencing：总之，作者对1792名参与者的粪便样本进行了分析：355名IBD患者，412名IBS患者和1025名对照者（表S1）。