4、自适应形状先验建模:在线字典学习的应用与实践

自适应形状先验建模:在线字典学习的应用与实践

1. 引言

在医学影像分析中,形状先验建模(Shape Prior Modeling)是一项关键技术,它利用已知的形状信息来指导图像分割,从而提高分割的准确性。近年来,稀疏形状组合(Sparse Shape Composition, SSC)作为一种非参数化方法,通过稀疏组合训练库中的形状实例来近似输入形状,取得了显著的成功。然而,随着训练形状实例数量的增加,SSC的运行效率会大幅降低。为了解决这一问题,本博客将介绍一种基于在线字典学习的自适应形状先验建模方法,该方法不仅提高了模型的灵活性和适应性,还在不牺牲建模能力的前提下显著提升了运行效率。

2. 稀疏形状组合(SSC)

2.1 稀疏形状组合的基本原理

SSC是一种非参数化方法,它通过稀疏组合训练库中的形状实例来近似输入形状。具体来说,SSC基于两个稀疏性观察来建模形状先验:
1. 给定一个大型器官形状库,同一器官的形状实例可以通过形状库中稀疏一组实例的组合来近似;
2. 由局部外观线索导出的形状实例可能有重大错误,但这些错误在空间上是稀疏的。

通过将形状先验建模表述为一个稀疏优化问题,SSC能够在纠正输入形状的重大错误的同时保留形状细节。以下是SSC的稀疏优化问题的数学表达:

[ \mathbf{x} i = \arg \min {\mathbf{x} \in \mathbb{R}^k} \frac{1}{2} | \mathbf{y}_i - D\mathbf{x} |_2^2 + \lambda | \mathbf{x} |_1 ]

其中,$\ma

复杂几何的多球近似MATLAB类及多球模型的比较 MATLAB类Approxi提供了一个框架,用于使用具有迭代缩放的聚集球体模型来近似解剖体积模型,以适应目标体积和模型比较。专为骨科、生物力学和计算几何应用而开发。 MATLAB class for multi-sphere approximation of complex geometries and comparison of multi-sphere models 主要特点: 球体模型生成 1.多球体模型生成:Sihaeri的聚集球体算法的接口 2.音量缩放 基于体素的球体模型和参考几何体的交集。 迭代缩放球体模型以匹配目标体积。 3.模型比较:不同模型体素占用率的频率分析(多个评分指标) 4.几何分析:原始曲面模型和球体模型之间的顶点到最近邻距离映射(带颜色编码结果)。 如何使用: 1.代码结构:Approxi类可以集成到相应的主脚本中。代码的关键部分被提取到单独的函数中以供重用。 2.导入:将STL(或网格)导入MATLAB,并确保所需的函数,如DEM clusteredSphere(populateSpheres)和inpolyhedron,已添加到MATLAB路径中 3.生成多球体模型:使用DEM clusteredSphere方法从输入网格创建多球体模型 4.运行体积交点:计算多球体模型和参考几何体之间的基于体素的交点,并调整多球体模型以匹配目标体积 5.比较和可视化模型:比较多个多球体模型的体素频率,并计算多球体模型原始表面模型之间的距离,以进行2D/3D可视化 使用案例: 骨科和生物力学体积建模 复杂结构的多球模型形状近似 基于体素拟合度量的模型选择 基于距离的患者特定几何形状和近似值分析 优点: 复杂几何的多球体模型 可扩展模型(基于体素)-自动调整到目标体积 可视化就绪输出(距离图)
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