药物靶点预测与胎儿头部定位的技术探索
药物靶点预测
在药物研发领域,为现有药物寻找新靶点(药物重新定位)是一项重要任务,其目的是发现现有药物的新临床用途。由于体外实验成本高且耗时,已知的基于实验室实验的药物 - 靶点相互作用数量有限,因此近年来计算预测变得越来越重要。
构建了一个基于大数据技术的推荐系统来预测药物 - 靶点关联。具体做法是,先从可用的蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)构建人类 PPI 网络,再结合已知的药物 - 靶点关联来训练系统。该方法的核心思想是,根据 PPI 网络中蛋白质的连接方式以及特定药物已知靶点的行为,预测该药物的新靶点。
以下是构建推荐系统的关键步骤:
1. 数据准备 :收集可用的 PPI 数据和已知的药物 - 靶点关联数据。
2. 网络构建 :利用收集到的 PPI 数据构建人类 PPI 网络。
3. 系统训练 :将 PPI 网络和已知的药物 - 靶点关联数据输入系统进行训练。
4. 靶点预测 :根据训练好的系统,结合 PPI 网络中蛋白质的连接和已知靶点行为,预测药物的新靶点。
在 Apache Spark 中实现该推荐系统的技术细节也有提供,并且可以对得到的结果进行可视化检查,包括涉及预测靶点的子网络。
胎儿头部定位
在妇产科领域,通过超声测量胎儿生物特征已成为常规操作。测量胎儿头围(HC)对于确定胎儿健康状况、估算胎儿年龄和预产期至关重要。然而,超声图像的解读需要专业的放射科医生或超声技师,
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