Bluescape的博客

2025年12月11日，中国农业大学张小兰团队在国际顶刊Science上发表了一篇题为“ARF3-mediated auxin signaling is essential for sex determination in cucumber”的研究论文。

2025年11月11日，天津大学王方忠教授团队在Chemical Engineering Journal（IF: 13.2）在线发表了题为Accelerated fatty acid biosynthesis by an RCC1-domain protein enables record-high productivity in Schizochytrium的研究论文，该研究借助DAP-seq技术阐明了RCC1结构域蛋白Srcc1在裂殖壶菌中调控脂肪酸生物合成的机制及其在高密度发酵中的应用，将微生物油脂生

2025年9月27日，中国农业大学孙其信院士/邢界文教授团队在Molecular Plant（IF: 24.1）在线发表了题为An incoherent feed-forward loop coordinates nitrate uptake and tillering in wheat的研究论文，该研究揭示了小麦中TaNLP3通过非一致性前馈环（incoherent feed-forward loop）协同调控硝酸盐吸收与分蘖的分子机制，还鉴定出可直接用于育种的优异单倍型。

2025年10月1日，浙江大学农业与生物技术学院汪俏梅教授课题组在Cell Reports（IF: 6.9）上在线发表了题为SlWRKY14 integrates carotenoid and flavonoid biosynthetic pathways to regulate coloration and quality of tomato fruits的研究论文。

2025年10月25日，南京农业大学国家大豆改良中心喻德跃教授团队在Plant Biotechnology Journal（IF: 10.5）上在线发表了题为GmMYB4 Positively Regulates Isoflavone Biosynthesis via the GmMAPK6-GmMYB4-MBW Module in Soybean的研究论文。

2025年7月29日，山西农业大学王升级团队在Industrial Crops & Products期刊发表了一篇题为“PagHSF4 mediates the biosynthesis of jasmonic acid and plant hormone signal transduction to regulate the growth and development as well as salt stress tolerance of poplar”研究论文。

2025年7月31日，山西农业大学王升级团队在Industrial Crops&Products期刊发表了一篇题为“ERF194 regulates poplar leaf development via the starch and sucrose metabolism under natural environments”研究论文。本研究聚焦杨树ERF194转录因子，借助DAP-seq技术揭示了其通过调控淀粉-蔗糖代谢通路影响叶片发育的分子机制，为杨树遗传改良提供理论与实验依据。

2025年7月，北京林业大学张德强教授课题组在New Phytologist（IF=8.1）发表了题为“Phylostratigraphic analysis revealed that ancient ohnologue PtoWRKY53 innovated a vascular transcription regulatory network in Populus”的研究论文。该研究借助DAP-seq技术揭示了全基因组复制（WGD）衍生的古老PS1 ohnologs（尤其PtoWRKY53）通过新功能

在林业科学研究中，杨树作为重要的模式树种和经济树种，其生长发育、抗逆性及木材形成的分子机制一直是研究热点。而解析转录因子与靶基因的相互作用，是解锁这些机制的关键。近期，北京林业大学张德强团队、山西农业大学王升级团队的3项杨树研究成果（发表于New Phytologist、Industrial Crops & Products）均采用我司DAP-seq技术，为杨树基因调控研究提供了核心支撑，该技术无需特异性抗体、无需转基因材料，即可高通量检测转录因子在全基因组结合位点，为杨树基因调控研究提供了高效技术解决方

2025年9月9日，浙江大学汪俏梅教授团队在Plant Communications （IF: 11.6）上在线发表了题为SlBES1-mediated brassinosteroid signaling suppresses flavonoid biosynthesis in tomato fruit的研究论文，该研究借助DAP-seq技术鉴定了SlBES1及其同源基因SlBZR1的全基因组靶基因，揭示其对番茄果实类黄酮合成的调控作用及机制，为番茄品质改良提供理论依据。蓝景科信为该研究提供了DAP-seq

2025年7月6日，浙江大学徐娟教授团队在New Phytologist期刊发表了一篇题为“A DELLA-ANAC106 reciprocal negative feedback circuit modulates gibberellin homeostasis to regulate male fertility in Arabidopsis”研究论文。该研究借助DAP-seq技术揭示了拟南芥中DELLA-ANAC106双向负反馈回路调控赤霉素（GA）稳态以维持雄性育性的分子机制，为植物生殖过程中植物激

qRT-PCR与LC-MS/MS结果显示，在SE途径中，LsfBZR2过表达抑制LsfWAG2表达，导致IAA积累，促进愈伤增殖；，揭示了BZR2-GRF5转录调控模块通过组织特异性调控生长素外排基因LsfWAG2，介导油菜素内酯（BR）与生长素（IAA）信号互作，双向调控体细胞胚胎发生（SE）与器官再生的分子机制，为木本植物再生机制研究与遗传改良提供了全新视角。表达，在SE中维持高生长素环境促进愈伤增殖，在器官发生中降低生长素水平以加速芽再生，形成组织特异性的双向调控机制。促进杂交枫香的芽再生。

通过Y2H验证、双分子荧光互补（BiFC）、分裂荧光素酶互补（Split-LUC）、Pull-down及荧光共振能量转移（FRET-AB）等试验，证实VqWRKY46与VqNF-YC9存在直接互作。接种葡萄白粉菌9 d后，与野生型（WT）相比，过表达植株表现出分生孢子数量减少、菌丝长度缩短，同时伴随胼胝质积累增加、过氧化氢含量升高及HR反应增强等现象，以及防御相关基因的表达水平显著上调；的上游调控机制，该研究通过酵母单杂交（Y1H）文库筛选，鉴定到转录因子VqLIMYB。的表达，进而介导葡萄白粉病抗性。

当OsJAZs被降解后，OsMYC2进入细胞核，与OsMYC3联手启动抗氧化酶、金属转运蛋白等基因的表达，增强水稻对病菌的抵抗能力。该研究突破了传统对JA信号调控的认知，构建了“OsBBI1→降解JA抑制因子→释放OsMYC2→激活防御基因”的完整调控链，证实E3泛素连接酶可通过“降解抑制因子”的方式快速激活免疫，为作物抗病机制研究提供了新思路。这些结果表明，OsMYC2和OsMYC3通过促进病原体诱导的防御基因表达和活性氧（ROS）积累，正向调控水稻对稻瘟病菌的免疫反应。对水稻稻瘟病抗性起正向调控作用。

如果您已有转基因材料，且有ChIP级别抗体的话，ChIP实验还是值得尝试的，毕竟能够拿到体内结果，若难以满足上述条件，且时间、经费有限，建议您优先考虑DAP-seq实验。参考基因组建议优先选择您日常分析中常用的版本，如果后续需要将DAP-seq数据与其他实验数据（如RNA-seq、ATAC-seq等）进行联合分析，请务必保证所有数据使用相同版本的参考基因组，这样才能确保分析结果的准确性和一致性。，即可揭示转录因子与DNA的互作网络，如今已成为植物学、微生物学等领域解析基因表达调控网络的关键技术手段。

表达后，其在拟南芥和多年生黑麦草中过表达均能提高植株存活率、相对含水量和叶绿素含量，降低丙二醛含量、离子渗漏和活性氧积累，减轻细胞损伤，增强耐旱性。但干旱处理后，突变株系存活分蘖率、株高、干重、相对含水量和叶绿素含量均低于野生型，离子渗漏率、丙二醛含量及活性氧积累则高于野生型，表明。结果显示，干旱条件下野生型多数萎蔫，而过表达株系存活率更高，离子渗漏率和MDA含量更低。的表达来增强植物的耐旱性，为多年生黑麦草的耐旱分子育种提供了重要的基因资源和理论依据。的过表达可缓解干旱条件下植物细胞膜的损伤。

香米因其独特的香味而受到全球的青睐，尽管2-乙酰-1-吡咯啉（2-AP）是水稻香气的主要成分，但除2-AP外水稻香气的代谢基础及香气代谢物积累的遗传机制（除OsBADH2和OsODC外）尚未明确，解析水稻香气的分子调控机制对香稻品种培育具有重要意义。已知GLK是叶绿体发育的主调控因子，但GLK突变体仍有残留叶绿素，DAP-Seq首次证明MYB相关因子通过直接调控光合系统组装和碳代谢基因，弥补了GLK缺失的功能，揭示了叶绿体发育的双重调控机制。）启动子的NACRS元件，负调控FAVs合成。

通过基因-转录-表型多个维度的数据挖掘，为果实品质基因编辑提供理论依据。本文将深度解读这一创新成果，解析DAP-seq和RNA-seq技术在植物发育研究中的应用价值。

喜报！DAP-seq项目文章发表Plant Physiology，本研究借助DAP-seq技术揭示了番茄果实成熟调控新机制，展示了DAP-seq技术在植物生长发育研究方面的关键作用。

喜报！DAP-seq项目文章发表Plant Physiol，本研究借助DAP-seq技术揭示了杨树通过“分子开关”PuZFP1协调侧根抑制与不定根伸长的抗旱策略，本文将深度解读这一创新成果，展示DAP-seq在植物逆境研究中的关键作用。

随后对不同颜色的软枣猕猴桃品种进行RNA-seq分析，并结合亚细胞定位结果，筛选出花青素调控相关的候选转录因子AaBEE1。经红色软枣猕猴桃果实中瞬时过表达，以及在拟南芥、番茄和烟草中稳定遗传转化实验验证，AaBEE1能够抑制花青素的生物合成和积累。进一步通过DAP-seq分析，发现AaBEE1在全基因组范围内存在457个结合峰，这些峰分布在29条染色体上，多数位于转录起始位点（TSS）上游2kb的启动子区域。软枣猕猴桃近年来备受青睐，它果实小巧，皮薄多汁，富含花青素，口感清甜，深受消费者喜爱。

随后为进一步研究了这些RLKs的转录水平是否受SHR和SCR的直接调控，作者使用了Chip-seq和DAP-seq技术检测这些转录因子和DNA序列之间的相互作用，结果发现这些RLKs的启动子和两种转录因子之间不存在相互作用。综上所述，该研究明确了ARH1、FEI1和FEI2三个受体激酶在整合SHR-SCR信号通路和GA信号来调控根基本组织模式中的关键作用，揭示了根基本组织发育的分子调控机制。”的研究论文，该研究揭示了受体激酶ARH1、FEI1和FEI2共同调控根基本组织发育的分子机制，并。

无需特异性抗体，无需转基因材料，物种不限（动物，植物，微生物），高通量检测转录因子在全基因组的结合位点

突破性发现！油菜BnaC3.LFY基因内含子变异调控开花时间，助力精准育种。DAP-seq和RNA-seq联合分析双剑合璧，结合SV-GWAS结果，从多个维度进行深度的数据挖掘，更全面、更深入地理解生命活动的奥秘。

RNA结合蛋白（RBP）在转录后调控中起关键作用，影响RNA的稳定性、定位、翻译和降解。RIP-seq（RNA免疫共沉淀测序）和Polysome Profiling（多核糖体分析）联合使用，可全面研究RBP与RNA的相互作用及其对翻译的影响。

然而，除了2-乙酰基-1-吡咯啉（2-AP）外，香气的代谢基础尚不清楚，香气代谢物积累的遗传基础在很大程度上也是未知的。结合RNA测序（RNA-seq）、KEGG富集分析、酵母单杂交（Y1H），双荧光素酶报告实验等方法，发现OsAROMA2（OsNAC021）能够直接与LOX途径的。此外，通过vGWAS分析，作者还发现与FAVs（己醛、辛醛、2-辛烯醛和1-庚醇）含量相关的基因位点共定位在。基因的启动子区域结合，并抑制这些基因的活性，从而负调控游离芳香族化合物（FAVs）的积累。

双DNA亲和纯化测序（dDAP-seq）技术是在DAP-seq基础上改进而来，可以检测异源二聚体的DNA结合特性。

该研究首次阐明了协调氮素吸收的直接途径和菌根途径的作用机制，完善了菌根氮素营养的调控网络，为进一步利用菌根途径提高作物氮素利用效率提供了理论基础和重要基因资源。鉴于OsPHR2和OsNLP3共同调控共生硝酸盐吸收，对OsNLP3和OsPHR2的潜在靶基因与在AM共生根中的差异表达基因（DEGs）进行了重叠分析。氮（N）是植物生长必需的营养元素，大多数陆地植物进化出了两种氮吸收途径：一种是直接通过根系吸收的途径，另一种是通过与丛枝菌根（AM）真菌共生的途径。

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的互作蛋白MdMYB54，并通过pull-down、Y2H、荧光素酶互补（Split-LUC）实验证实MdMYB54与MdERF114在体外和体内均直接相互作用。的抗性，表现为植株生长受抑制程度减轻、根相对电导率（REL）和丙二醛（MDA）含量降低、根活性提高、根部病斑数量和面积减少；感染苹果根中的调控机制，为理解其在缓解苹果再植病挑战中的作用提供了依据，为提高苹果产量和品质、培育优良砧木新品种奠定了理论基础。的抗性，表现为植株生长改善、根损伤减轻、REL和MDA含量降低、根活性提高。

无需针对每种蛋白制备特异性抗体，无需构建转基因体系，高通量检测转录因子及DNA结合蛋白的结合位点。蓝景科信可提供DAP-seq全流程技术服务和个性化数据分析，具有100多个物种，2000多个转录因子的实验经验，已协助很多客户成功发表文章。

文章借助DAP-seq技术探究了SmHSFA8通过调控SmEGY3-SmCSD1模块和SmF3H介导的类黄酮生物合成提高茄子耐热性的分子机制。

2024年7月26日，中国农业科学院棉花研究所张永山研究员团队在Plant Biotechnology Journal（影响因子10.1）杂志上发表了题为“GhSBI1, ahomologue, modulates branch internode elongation in cotton”的文章，该研究借助DAP-seq和转录组等技术，鉴定了GhSBI1下游靶标基因，揭示了其对棉花果枝节间伸长的抑制作用机制。棉花（Gossypium）是世界上主要的天然纤维来源，也是重要的油料和蛋白作物。

银杏萜内酯是银杏中重要的天然药用活性成分，具有抗血栓、抗炎、治疗心脑血管疾病和预防阿尔茨海默病等药理活性，也是血小板活化因子的强拮抗剂。萜内酯在银杏中的含量极低，难以满足医药行业的需求，限制了银杏产业的发展和临床应用。许锋教授借助DAP-seq技术揭示了MYC2转录因子通过激活银杏中GbGGPPS的表达正向调控萜内酯生物合成的分子机制。为通过基因工程提高银杏中萜内酯含量提供了研究基础和靶基因。

该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了杨属YABBY11转录因子的结合基序和靶基因。发现YABBY11与杨树叶形自然变异显著关联，为探索理想叶形遗传改良奠定了理论基础。

DAP-seq高通量地检测转录因子在基因组上的结合位点，鉴定下游靶基因。蓝景科信拥有100+物种，1000+转录因子的DAP-seq实验经验。

DAP-seq高通量地鉴定转录因子在基因组上的结合位点，预测下游基因。该研究使用DNA亲和纯化测序（DAP-seq）技术鉴定了葡萄中一个MADS-box转录因子的结合基序及其靶基因，揭示了VvMADS28参与葡萄胚珠和种子发育的调控机制，为培育无籽葡萄新品种奠定了理论基础。

100+物种，1000+转录因子的实战经验，高通量鉴定转录因子的下游基因，已助力多篇文章发表知名期刊，例如：Molecular Plant，The Plant Cell，Plant Physiology，Plant Biotechnology Journal，Journal of Integrative Plant Biology等。

期刊：Plant CellIF=12.085

期刊：Molecular Plant影响因子：21.949