高速测量小鼠躯体感觉反射行为的新方法
1. 数据降维与急性疼痛量表构建
为了得到一个能涵盖六个亚秒级运动特征的简单一维分数,采用了主成分分析(PCA)的方法。具体步骤如下:
1. 数据标准化 :将以不同单位(如毫米、毫米/秒等)测量的原始数据转换为z分数,这样做既能对数据和单位进行归一化,又能直观呈现每个数据点与整体均值的偏离程度。
2. 主成分分析 :借助SAS软件开展主成分分析以实现降维,该过程会为每个测量值生成贡献权重,即特征值。
3. 绘制PC分数 :绘制主成分分析分数(PC分数)后,数据会沿着 -3 到 3 的连续尺度排列。观察发现,无害刺激对应的PC分数通常为负,而疼痛刺激对应的分数通常为正。所以,“0”可作为一个理想的分界点,从统计学角度区分触摸和疼痛。这种PC分数的线性分布似乎构成了一个小鼠“急性疼痛量表”。
下面是一个简单的流程图展示这个过程:
graph LR
A[原始数据] --> B[转换为z分数]
B --> C[主成分分析]
C --> D[生成PC分数]
D --> E[绘制PC分数图]
E --> F{"判断正负"}
F -- 负 --> G[无害刺激]
F -- 正 --> H[疼痛刺激]
2. 监督式机器学习预测疼痛概率
为了更方便地解读小鼠爪子回缩反射,利用部分收集的数据(棉拭子和
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