慢性阻塞性肺疾病中肺气肿亚型的无监督发现
1. 引言
慢性阻塞性肺疾病(COPD)是一种以气流不畅为特征的慢性肺部疾病,肺气肿是COPD的标志性病症之一,表现为肺肺泡的破坏和空气腔的永久性扩大。目前已识别出几种肺气肿亚型,这些亚型常用于诊断和预测患者的预后,并且与遗传数据和生理指标相关。
在计算机断层扫描(CT)中,肺气肿呈现出多种纹理,这些纹理与临床定义的疾病亚型相关。然而,在CT图像中识别亚型时,存在显著的读者内和读者间差异。计算方法有望识别出人类读者难以察觉的细微纹理差异,从而产生明确、可重复的疾病亚型。此外,当患者群体的异质性得到表征时,计算方法还可能为疾病提供新的见解。
本文提出了一种同时检测不同患者群体和疾病亚型的方法。该算法基于生成模型,假设每个患者群体与不同的疾病亚型分布相关。通过变分期望最大化(EM)算法进行推理,并将其应用于包含2457次胸部CT扫描的数据集,观察到生理指标与所识别的患者群体和疾病亚型之间存在显著关联。
2. 模型
2.1 生成模型
生成模型假设存在K个潜在的患者群体,每个群体具有不同的疾病亚型分布。研究中共有N次CT扫描,每次扫描处理后由R个不重叠的补丁表示。对每个补丁应用特征提取方法,构建特征向量{Fnr}作为算法的输入。
在实验中,使用灰度共生矩阵(GLCM)特征和强度直方图的组合作为特征描述符,这些描述符均从三维补丁中提取。
患者的群体分配分布由π参数化,用向量Cn表示。对于群体k中的所有患者,疾病亚型的分布由αk参数化,用Lnr表示。每个补丁属于S种疾病亚型之一。使用高斯分布N(·; μ, Σ)对疾病亚型s中的特征向量进行建模。
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