医学图像分割质量控制与半监督学习方法研究
在医学图像领域,准确的分割和高效的学习方法至关重要。本文将介绍两种先进的技术,一种是用于脑肿瘤分割质量控制的 QCResUNet,另一种是解决半监督医学图像分割挑战的 Meta - Learning for Bootstrapping Medical Image Segmentation(MLB - Seg)。
1. QCResUNet 用于分割质量控制
1.1 实验数据
本研究使用了 2021 年脑肿瘤分割(BraTS)挑战的术前多模态 MRI 扫描数据,包含不同等级的神经胶质瘤。每个受试者的数据有四种模态:对比前 T1 加权(T1)、T2 加权(T2)、对比后 T1 加权(T1c)和液体衰减反转恢复(FLAIR),还有专家标注的多类肿瘤分割掩码。所有数据都已注册到标准解剖图谱并进行了颅骨剥离,然后进行 z 评分处理,最后裁剪到非零值区域并零填充到 160 × 192 × 160 大小以输入网络。
1.2 数据生成
为了提供无偏的分割质量估计,采用了三步方法扩展初始数据集:
1. 使用 nnUNet 框架 :分别使用不同模态(T1 单独、T1c 单独、T2 单独、FLAIR 单独和四种模态全部)训练 nnUNet 框架五次。由于每种模态只能捕捉特定组织类型,因此可以生成各种质量的分割结果。
2. 不同迭代采样 :在训练过程的不同迭代中采样分割结果,选择小学习率(1×10⁻⁶)来减缓模型收敛,以便从低质量到高质量逐步采样分割结果。
3. SegGen 方法
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