组学数据分析实操系列 | （六）蛋白相互作用域可视化分析

前言：

在前面的蛋白互作组学系列文章中（蛋白互作组学系列丨（七）蛋白互作结构域的预测分析），我们曾向大家分享过如何使用ZDOCK进行蛋白相互作用结构域预测与分析。这一期我们将向大家展示如何使用Pymol（https://pymol.org/2/）对蛋白互作结构域进行可视化分析。

Pymol是一个很强大的蛋白结构分析可视化软件。这一期的蛋白相互作用结构域可视化分析与后续的小分子-蛋白对接专题都会使用到Pymol这个软件。其操作界面和各部分的功能如图1所示。今天我们展示的分析流程需要先用Pymol对蛋白结构进行预处理，然后用ZDOCK进行分子对接，再用Pymol将对接结果进行可视化。

图 1 Pymol使用简介

一、蛋白结构下载与预处理

以已知的相互