- DNA 凝胶电泳通过电场分离 DNA 片段大小,需要电泳槽、电源、凝胶托盘、染料和成像系统。
DNA 凝胶电泳
- 凝胶电泳(英语:Gel electrophoresis)或称胶体电泳,是一种用于大分子(如DNA、RNA、蛋白质)以及其碎片的分离、分析技术。该技术被科学工作者用于分离具有不同物理性质(大小、电荷、等电点)的分子。凝胶电泳通常用于分析用途,但也可以作为预处理技术,在进行质谱、聚合酶链式反应、克隆、DNA测序或者免疫印迹等检测之前,进行分子的纯化。
- 它的原理是:带负电荷的 DNA 分子在电场中朝阳极移动,并根据片段大小在凝胶中迁移速度不同,实现分离。
电泳设备组成
组件 | 是否必要 | 原因说明 | 可替代方案 |
---|---|---|---|
电泳槽(gel tank) | 必需 | 提供凝胶运行空间,容纳缓冲液和电极 | 自制塑料盒 |
电泳电源(power supply) | 必需 | 提供恒定电压使 DNA 迁移 | 可用 9V 电池串联(仅教学演示) |
凝胶托盘(tray) | 必需 | 承载凝胶,使其浸泡在缓冲液中,保持平整 | 可用玻璃片、塑料片代替 |
梳子(comb) | 必需 | 形成加样孔 | 可自制,用塑料片/压板打孔 |
琼脂糖凝胶(agarose gel) | 必需 | DNA 迁移介质,决定分辨率 | 无替代(必须使用琼脂糖) |
缓冲液(TAE/TBE) | 必需 | 导电 + 稳定 pH,维持 DNA 结构 | 自配 TAE/TBE(不能用纯水) |
样品染料(Loading buffer) | 强烈推荐 | 加重样品下沉 + 显色追踪迁移前沿 | 也可自配(含甘油+染料) |
DNA 染料(EtBr/GelRed) | 可选(视用途) | 染色观察 DNA,便于成像 | 可后染,不染时可用紫外吸收检测 |
紫外成像仪(UV灯) | 可选(看染料) | 用于检测荧光染料标记的 DNA 条带 | 蓝光灯 / 蓝光板拍照 / 手持 UV 灯 |
DNA 凝胶电泳设备获取或自制方案
购买整套电泳系统
选项 | 推荐品牌/平台 | 说明 |
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专业电泳仪器 | BIO-RAD、Thermo、GelDoc | 科研级、价格较高(上千~上万) |
教学/科研套装 | 购物网站购买 DNA电泳仪、电泳仪套装、电泳电源、凝胶成像系统:如 蓝天、金鹏、六一仪器 | 价格几百~几千,适合实验室或教学用 |
染料安全版本 | 使用 GelRed / SYBR Safe,配蓝光检测仪 | 更安全,无需紫外线伤害 |
DIY 简易自制电泳设备(适于教学)
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教学或爱好者,可以用以下材料简易制作电泳设备:
自制部件 | 材料建议 |
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电泳槽 | 食品级塑料盒 + 塑料托盘 |
电源 | 可调电源或 9V 电池串联(不建议长期使用) |
凝胶托盘 | 切割透明塑料片 |
梳子 | 亚克力板或 3D 打印制作 |
缓冲液 | 自配 TAE:Tris + Acetate + EDTA |
染料 | 使用 GelGreen 或 GelRed(无毒版本) |
- 简易自制电泳设备教程资源汇总表
教程名称 | 来源(含链接) | 简介 | 特点 | 适用人群 |
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DIY Gel Electrophoresis Box | Instructables | 使用塑料盒、电极线、铝箔等材料制作电泳槽和梳子 | 附图详解 | 教学 / DIY 爱好者 |
迷你凝胶电泳系统 DIY | 知乎 | 利用亚克力板制作小型凝胶系统,自带电极结构 | 教学级别,细节丰富 | 大学实验室 |
Build a Gel Electrophoresis Chamber | University of Utah | 提供图纸、尺寸,适用于亚克力板和 Teflon 电极 | 英文教学文档,附结构尺寸 | 工科类学生、教师 |
$25 DIY Gel Box | Hackteria Wiki | 极简版,使用塑料容器、文具电极等 | 成本超低(<$30),适合初学者 | 学生、科普活动 |
Homemade Agarose Gel Electrophoresis | Instructables | 用家居材料+食品染料代替 DNA 实验教学演示 | 无需 DNA,安全演示型 | 中小学教学、家庭教育 |
DIY Electrophoresis Gel Box 视频 | YouTube | 实拍简易电泳系统搭建过程,含加样、通电演示 | 直观,适合跟学 | 所有人 |
DNA样品染料
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DNA 溶液通常是水性(如 ddH₂O 或 TE 缓冲液),密度接近水。如果直接将 DNA 溶液加入到电泳凝胶的加样孔中:
- 很容易悬浮在缓冲液表面
- 难以下沉进入孔底
- 可能导致样品溢出、混井、污染其他孔
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DNA样品染料可 使 DNA 样品沉到底部的加样孔中,从而顺利注入凝胶,不会漂浮或溢出。样品染料的密度远高于水,混入后可使 DNA 样品顺利沉入电泳孔底,避免漂浮和跑偏,是电泳成功的关键步骤之一。
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样品染料中一般含有:
成分 | 推荐浓度 | 功能说明 |
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甘油(Glycerol)或蔗糖(Sucrose) | 60% (v/v) | 增加溶液密度,使样品沉到底部加样孔 |
溴酚蓝(Bromophenol Blue) | 0.25% (w/v) | 显色指示迁移前沿,代表约 300 bp |
二甲苯青 FF(Xylene cyanol FF) (可选) | 0.25% (w/v) | 显色指示较大片段,代表约 4–5 kb |
EDTA (可选) | 1–2 mM | 螯合金属离子,抑制核酸酶降解 DNA |
Tris-HCl(pH 7.5) (可选) | 10 mM | 缓冲体系,稳定 pH 环境 |
ddH₂O | 补足至 10 mL 总体积 | 溶剂 |
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按 1:5 或 1:6 混入 DNA 样品中,如:1 µL buffer + 5 µL DNA。 放入 –20℃ 冻存长期保存,4℃可保存数周。
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如果预算紧张或追求配方可控,可自制 Loading Buffer;如果图方便、安全稳定可在线购买:
产品名 | 规格 | 价格参考 | 描述 | 备注 |
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索莱宝 DNA Loading Buffer 6× | 1 mL / 5 mL | ¥20–40 | 索莱宝 DNA上样缓冲液 | 国产常用品牌 |
碧云天 6× DNA Loading Buffer | 1 mL / 5 mL | ¥15–35 | 碧云天 loading buffer | 教学/科研都常用 |
TaKaRa Loading Dye | 1 mL / 100 次 | ¥100+ | TaKaRa DNA loading buffer | 国际品牌,进口 |
艾克瑞 上样染料 6× | 1 mL / 5 mL | ¥10–20 | Accurate DNA上样液 | 适合学生教学 |
凝胶
- 取 1g 琼脂糖 + 100 mL TAE 缓冲液
- 加热溶解(微波炉或电炉)
- 稍冷后加入 DNA 染料,倒入托盘
- 插入梳子,待凝固后移除即可上样
- 注意安全:如用 EtBr 染料或紫外灯,一定要穿戴防护手套、眼镜。
染料
-
GelGreen 是一种安全、灵敏的 DNA 荧光染料,用于在电泳中观察 DNA 条带,推荐用于替代 EtBr。
-
在 DNA 凝胶电泳中,GelGreen 的作用 将 DNA 条带可视化,使其在蓝光或紫外灯下发出绿色荧光,便于观察和拍照:
项目 | 说明 |
---|---|
功能 | 与 DNA 分子结合(插入 DNA 双链结构中),在电泳后通过光照激发发光 |
激发波长 | 500 nm(蓝光)或 302 nm(紫外) |
发射波长 | 530 nm,绿色荧光 |
使用方法 | 可在琼脂糖胶制备时加入(预染),或跑完电泳后泡染(后染) |
替代品 | 替代传统染料 EtBr(溴化乙锭) |
安全性 | 非致突变性设计(比 EtBr 更安全)、可直接倒入下水道(环保) |
兼容设备 | 可配合蓝光凝胶成像仪或紫外灯成像仪使用 |
使用方式
1. 预染法:
在配制琼脂糖凝胶时,每 100 mL 热的 TAE/TBE 凝胶液中加入 5 µL GelGreen。
- 好处:一步完成,无需染胶步骤
- 缺点:略贵,可能有荧光背景(尤其高浓度DNA时)
2. 后染法:
电泳结束后将凝胶放入含 GelGreen 的缓冲液中染色 20–30 分钟。
- 好处:省染料,清晰可控
- 缺点:增加操作时间
⚠️ 注意事项
- 不要直接加 GelGreen 到 DNA 样品中! 否则迁移可能受影响。
- 使用蓝光灯时避免长时间曝光,可延长染料与 DNA 的稳定性。
- GelGreen 也适用于 RNA 染色(兼容性较好)。
- 故溴化乙錠是一種強的誘變劑,可致癌或致畸。 大學生物實驗經常會使用此染料,操作時必須要佩戴手套並且儘可能的避免任何接觸。 含有溴化乙錠的廢液應當經過處理才能排放
- 你不可不知道實驗室的隱形殺手–溴化乙菲錠(EtBr)
- 各种 EB 替代物凝胶核酸染料的细胞渗透性、安全性及灵敏度的比较 市场上基于 EB 在一些试验如 Ames 测试中表现出来低诱变性,因而认为核 酸染料比 EB 更加安全,许多厂商在他们的商标上都冠以安全的字号。我们 发现这几种染料都能迅速透过细胞并且跟细胞核反应,增加了活细胞或者 DNA 损伤的可能性。GelRed™和 GelGreen™已由各独立实验室证实其无 法进入活细胞, 因此无毒。
结果成像与解读
成像方式 | 说明 |
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紫外凝胶成像系统 | 最常见(EtBr 染料需紫外激发) |
蓝光凝胶成像仪 | 更安全(适用于 GelRed、SYBR Safe) |
手持紫外灯 | 教学用,需注意眼部和皮肤防护 |