和鲸101计划:R语言医学数据分析,复现顶刊图表

历时一个月,和鲸社区内的 R 语言医学数据分析训练营暂告一段落。

本次训练营由上海交通大学医学院副研究员张维拓老师联合和鲸社区共同发起,是面向医学生、临床医生及相关从业人员开展的医学数据科学推广公益活动,旨在帮助大家快速入门 R 语言,了解临床研究标准分析流程,并能在论文复现的过程中学会做出符合顶刊发表要求的论文图表。

考虑到报名的大多数医学专业的学员可能不具备 R 语言编程基础,本次活动别开生面地采用了“线上训练营+线下工作坊”的混合式教学模式:线上训练营提供三份“提前学”教案,搭配张老师的讲解,帮助大家打下必要的医学数据分析的概念和技术基础;线下工作坊拔高难度,学员在老师和助教的指导下完成分组实操练习。

线上训练营:顶刊论文复现从图表开始

线上训练营的目标是带领大家复现 2015 年发表于 NEJM 的 A Randomized Trial of Intensive versusStandard Blood-Pressure Control(又被称为 SPRINT 研究)论文中的主要统计分析方法,并制作符合论文发表要求的图表

医学论文中的图表制作一直是个难点,对于医学生来说很少有特定的课程专门教授图表的制作,计算机或统计学专业的学生也无法胜任,因为它不仅需要编程技术,更需要对专业知识的理解与分析思路。张维拓老师在线上第一节课中讲解医学数据分析的三个基本概念——“数据+科学问题+分析框架”时就说到,很多学生一上来就做很多各式各样的图表,但关注的问题是散的,这是不对的。

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