斯坦福联合研究项目 论文解读 | HOMER:通过混合模仿学习和全身控制实现野外移动操作

研究背景

在移动操作机器人领域,近年来的研究重点逐渐从实验室环境转向真实世界应用场景。传统移动操作机器人在面对家庭、办公室等非结构化日常环境时,暴露出诸多难题。

面临控制复杂性高(如基座与手臂协调困难)、泛化能力弱(对新物体和场景适应性差)、数据效率低(需大量演示数据)等难题

为此,斯坦福大学和剑桥大学研究团队提出HOMER 框架,通过结合基于运动学的全身控制器(处理基座与手臂协调)和混合模仿学习策略(切换长距离绝对姿态与精细操作相对姿态预测),并整合视觉语言模型提升泛化能力

1:左图:演示者通过全身iPhone 远程操作,利用移动机械臂在真实家庭环境中收集数据。右图:HOMER 从这些收集到的演示数据中,学习到一种混合模仿学习策略,该策略会在用于抵达目标的绝对动作与用于精细操作的相对动作之间进行切换。一个全身控制器将这些末端执行器指令映射为手臂和基座的关节指令,以执行操作。

研究方法与实验框架

HOMER 框架的核心由三部分构成:

全身控制器(WBC):基于运动学,将末端执行器的目标姿态映射为移动基座和机械臂的关节位置命令,通过优化目标函数(包括末端执行器姿态跟踪、关节姿态保持接近中性位置、基座运动阻尼等)和约束条件(关节速度、位置限制及碰撞避免),实现协调运动。

从形式上看,WBC是一个映射W:SE(3)→R3+N,它能将期望的末端执行器位姿 xee∈SE(3) 转换为移动基座和机械臂的关节位置指令 q∈R3+N。研究人员实现了一个基于迭代逆运动学(IK)的求解器,该求解器的目标是找到使位姿误差最小的 q。为了计算能让末端执行器朝 xee 移动的速度,将位姿误差定义为体坐标系下的扭转:eee=log

HOMER(Hypergeometric Optimization of Motif EnRichment)是生物信息学中用于分析高通量测序数据的重要工具集,在转录因子结合位点发现、染色质状态分析等方面有广泛应用。 ### 应用 - **转录因子结合位点(TFBS)分析**:HOMER可以从ChIP - seq数据中识别转录因子结合的DNA序列模式。通过分析这些模式,能够了解转录因子与哪些DNA区域相互作用,进而揭示基因表达调控的机制。例如在研究细胞分化过程中,特定转录因子的结合位点变化可以指示基因表达网络的重塑。 - **染色质可及性分析**:对于ATAC - seq或DNase - seq数据,HOMER可以用于发现染色质开放区域,这些区域通常与基因的活性调控相关。通过比较不同细胞类型或处理条件下的染色质可及性,能够找到差异开放区域,为研究基因表达的表观遗传调控提供线索。 - **组蛋白修饰分析**:ChIP - seq实验也常用于检测组蛋白修饰,HOMER可用于分析这些修饰的分布模式。不同的组蛋白修饰与基因的激活、抑制等功能状态相关,因此通过HOMER分析可以深入了解染色质的功能状态基因表达调控。 ### 工具 - **findMotifsGenome.pl**:该工具用于在基因组序列中寻找转录因子结合基序。用户可以输入ChIP - seq峰文件基因组序列文件,它会输出显著富集的基序信息,包括基序的序列、富集程度等。 ```bash findMotifsGenome.pl peaks.bed hg19 output_directory -size 200 ``` - **annotatePeaks.pl**:用于对ChIP - seq或ATAC - seq峰进行注释,将峰与基因、基因组特征(如启动子、增强子等)关联起来。 ```bash annotatePeaks.pl peaks.bed hg19 > annotated_peaks.txt ``` - **makeTagDirectory**:用于创建标签目录,将测序数据(如BAM文件)转换为HOMER可处理的格式,方便后续分析。 ```bash makeTagDirectory tag_directory sample.bam ``` ### 教程 - **官方文档**:HOMER的官方网站提供了详细的文档,包括工具的使用说明、参数解释示例。官方文档是学习HOMER的重要资源,能够帮助用户快速上手深入了解工具的功能。 - **在线教程博客**:许多生物信息学相关的博客在线平台(如Biostars、Stack Overflow等)上有用户分享的HOMER使用教程经验。这些教程通常结合实际案例,能够帮助用户更好地理解应用HOMER。 - **书籍课程**:一些生物信息学的书籍在线课程中也会涉及HOMER的使用。例如《Bioinformatics Data Skills》等书籍可能会有相关章节介绍高通量测序数据分析工具,包括HOMER
评论
成就一亿技术人!
拼手气红包6.0元
还能输入1000个字符
 
红包 添加红包
表情包 插入表情
 条评论被折叠 查看
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值