匈牙利算法计算GED

论文阅读+实战:SimGNN:A Neural Network Approach to Fast Graph Similarity Computation 图相似性搜索是最重要的基于图的应用程序之一,例如查找与查询化合物最相似的化合物。图相似度/距离计算,例如图编辑距离(GED)和最大公共子图(MCS),是图相似度搜索和许多其他应用程序的核心操作,但在实践中计算成本很高。作者受最近神经网络方法在几种图应用(例如节点或图分类)中取得成功的启发,提出了一种基于神经网络的新方法来解决这个经典但具有挑战性的图问题,旨在减轻计算负担的同时保持良好的性能。 阅读详情

time:2020.5.20
文章标题《approximate graph edit distance computation by means of bipartite graphs matching》
GED计算通常构建一个搜索空间树,其中根节点表示开始搜索的空节点。这课树的构造是在搜索过程中建立的,在以往的算法[22]中,通常需要全部遍历到叶子节点(叶子节点不一定是最佳的编辑路径),采用“best-first”思路:设定启发式函数h(f) + g(f)。g表示从根的编辑操作空节点到当前节点的代价,h表示从当前节点到最佳叶子节点的代价。

h的值(余下的编辑路径的下限)前人有俩种规定:h=0,表示对于当前编辑节点不使用启发式的信息;h=从当前分支节点到叶子节点的最佳路径的代价,这表明了h此时不再是下限,而是最佳编辑路径的成本值。因此本文使用介于这俩种h之间的值,去预估从当前编辑节点到叶子节点的最下值。

rdkit&networkx | 通过图编辑距离GED计算分子相似性 定义 图的编辑距离计算(Graph Edit Distance Computation)是指,对两个图之间通过点和边的insert、delete、substitute操作完成相互转换所需要的最少操作数。GED问题是一个NPC问题,同时也是许多图上应用问题,比如图分类问题、图匹配问题、图相似度搜索问题的核心操作。 代码 from rdkit import Chem import networkx as nx def get_graph(mol): Chem.Kekulize(mol) at 阅读详情

相关推荐

26、图编辑距离的最新进展

本文详细探讨了图编辑距离(GED)的最新研究进展,包括新算法的提出、编辑成本的学习方法以及计算性能优化技术。近年来,随着图数据量的增长和应用场景的拓展,如计算机视觉、生物信息学和化学信息学等,GED的研究取得了显著成果。文章还介绍了相关工具库(如GEDLIB)的使用步骤,并通过表格和流程图形式直观展示了不同算法的性能对比及应用流程。尽管面临计算复杂度高和编辑成本难以确定等挑战,启发式搜索、多阶段优化和数据预处理等解决方案正在推动该领域的发展。未来,深度学习与GED的结合、多模态数据融合以及大规模图数据处理将

m0n1o2p的博客 133

量子计算论文精讲 | 图编辑距离近似解探究

图表示能非常好的反映对象的属性与对象之间的关系,被广泛的应用在模式识别领域,而图匹配方法,作为实现图高效查询的重要方法之一被广泛的应用于生物信息学,图像分类,计算机网络等等领域。而图编辑距离(Graph Edit Distance,GED)是非常重要的图匹配问题,有良好得到容错率且可以应用于大量的图匹配相关领域之上。由于精确解GED问题的指数难度,越来越多的近似图编辑距离算法希望通过更快的时间来得到尽可能接近精确的图编辑距离。

2401_83053014的博客 2002

15、图编辑距离的优化算法

本文探讨了图编辑距离(GED)的优化算法及其在多个领域的应用。内容涵盖传统优化方法如匈牙利算法和贪心算法,以及新型优化方法包括基于机器学习和深度学习的技术。同时,介绍了并行和分布式算法、启发式搜索策略,并通过性能评估比较不同方法的效果。文章还展示了GED优化算法在图像检索、字符识别及社交网络分析中的具体应用,并展望了未来发展方向。

m0n1o2p的博客 212

利用公共子图同构计算图编辑距离相似度(CSI_GED:An Efficient Approach for Graph Edit Similarity Computation ICDE2016)

用边映射的方法,寻找最佳匹配的路径

CaptureItTechnology的博客 4668

55、利用GNCCP近似图编辑距离及对应广义中位数计算方法

本文介绍了利用渐进非凸性和连续性过程(GNCCP)近似计算图编辑距离(GED)的方法,并比较了其与IPFP等现有方法的性能。实验结果表明,GNCCP在精度上表现更优,但计算时间较长。此外,文章探讨了对应关系广义中位数(GM)的两种计算方法:基于一阶信息的最小化方法和更具灵活性的迭代方法,分析了各自的适用场景与优缺点。最后提出了未来在计算效率优化、应用拓展和技术融合方面的研究方向。

linux的博客 69

8、图匹配与编辑距离

本文详细探讨了图编辑距离(GED)的定义、计算方法及其在多个领域的应用。图编辑距离是一种衡量两个图之间差异的重要度量,通过节点和边的插入、删除和替换等编辑操作来计算最小成本路径。文章介绍了精确和近似计算方法,并重点讨论了其在模式识别、图像处理、社交网络分析和文档分析中的实际应用。此外,还涵盖了图编辑距离的优化技术,如启发式算法、并行计算以及最新的研究成果,如机器学习辅助的编辑成本优化和图嵌入模型的发展。最后,文章展望了未来发展方向,包括更高效的计算方法、更广泛的应用领域以及智能化的优化算法。

m0n1o2p的博客 176

Exact Computation of Graph Edit Distance for Uniform and Non-uniform Metric Edit Costs

精确计算GED三种方法(BLP_GED、CSI_GED、DF_GED)的比较和总结

CaptureItTechnology的博客 918

15、图编辑距离与网格挖掘算法详解

本博客详细介绍了图编辑距离的计算方法及其在分类任务中的应用,重点讨论了不同邻域定义和分配求解器对运行时间和分类精度的影响。此外,博客还提出了一种高效的网格挖掘算法GriMA,该算法利用网格图的刚性拓扑结构和角度信息,有效解决了传统图挖掘算法在处理网格时的扩展性问题。实验结果显示,GriMA在图像分类任务中表现优异,相比基于视觉词包(BoWs)的技术,能够更好地利用空间信息,生成更具判别性的特征。博客总结了图编辑距离与网格挖掘算法的研究价值,并展望了未来可能的研究方向和应用场景。

wasm7browser的博客 66

每天学习记录

每天重要的知识点记录 ...

CaptureItTechnology的博客 338

55、基于GNCCP近似图编辑距离及对应广义中位数计算

本文探讨了基于GNCCP的图编辑距离(GED)近似计算方法及其在广义中位数(GM)对应关系中的应用。通过将GED建模为二次分配问题,并采用渐进非凸性和凹性过程(GNCCP)松弛策略,与传统的整数投影定点法(IPFP)相比,GNCCP无需初始映射且直接收敛至映射矩阵,在化学数据集实验中展现出更高的准确性。同时,本文比较了计算广义中位数的最小化方法和迭代方法:最小化方法基于线性分配问题,能精确求解但受限于汉明距离;迭代方法适用于各种距离函数,但仅能提供次优解。最终提供了决策流程以指导在不同场景下选择合适的方法,

wasm7browser的博客 66

9、基于向量空间嵌入的图分类与聚类:理论与应用

本文探讨了基于向量空间嵌入的图分类与聚类方法,重点解决了图域中缺乏数学结构和算法工具的问题。通过将图嵌入向量空间,可以利用现有的模式识别算法对图进行高效分类和聚类。文章介绍了图匹配、图编辑距离的计算方法,并提出了基于差异表示的图嵌入框架,结合原型选择和优化策略,显著提升了图分析的性能。实验表明,该方法在多个数据集上表现出色,为图分析提供了一种强有力的新途径。

peach的博客 141

Comparing stars: on approximating graph edit distance 2009

基于STAR星结构

CaptureItTechnology的博客 644

【信息科学与工程学】计算机科学与自动化——第三百零五篇 计算机系统中的各类运算操作02

编号类型领域运算操作运算类型算法算法的详细设计及数学分析参数列表及参数的数值设计应用场景301集合运算关系代数关系集合Feature Selection (Chi-Square)集合运算卡方检验目标函数:χ2=∑E(O−E)2​ 衡量分类特征与目标的相关性;资源:O(n·d);条件:离散特征,离散目标;组合约束:值越大相关性越强。 数据结构:列联表。 代码实现(C++): 特征列,目标列文本分类中的特征选择。302集合运算关系代数关系集合Feature Selection (ANOVA F

weixin_49199313的博客 309

An Exact Graph Edit Distance Algorithm for Solving Pattern Recognition Problems

2015年的文章,已经用python实现,必应搜索networkx.simialrity.py 图形编辑距离是一种容错匹配技术,可用于解决模式识别,机器学习和数据挖掘中的不同任务的强大而灵活的图形匹配范例;它表示通过插入,删除和替换顶点和/或边线将一个图形转换为另一个图形的最低成本顺序。 精确图形编辑距离计算的一种广泛使用的方法是基于A算法。 为了克服遍历要存储的待解决方案的搜索树时遇到的高内存负...

CaptureItTechnology的博客 1416

匈牙利算法

匈牙利算法是一种在多项式时间内求解任务分配问题的组合优化算法,并推动了后来的原始对偶方法。美国数学家哈罗德·库恩于1955年提出该算法。此算法之所以被称作匈牙利算法,是因为算法很大一部分是基于以前匈牙利数学家Dénes Kőnig和Jenő Egerváry的工作之上创建起来的

aproximated_ged:一堆近似图编辑距离算法

近似图编辑距离 一堆近似图编辑距离算法。 演算法 作业编辑距离(AED) [1]阶O((n_1 + n_2)^ 3)的上限 Hausdorff编辑距离(HED) [2]阶O(n_1 * n_2)的下限 参考书目 [1] Riesen,Kaspar和Horst Bunke。 “ ”图像和视觉计算27.7(2009):950-959。 [2] Fischer,Andreas等。 “ ”模式识别48.2(2015):331-343。 作者 ( ) ( )

Graph Similarity Search with Edit Distance Constraint in Large Graph Databases通过分支(Branch)构建编辑距离下界

文章简介: 文章标题:Graph Similarity Search with Edit Distance Constraint in Large Graph Databases 文章来源:CIKM 2013 作者单位: 郑伟国 北京大学 邹雷 北京大学 德克萨斯州湘联大学-泛美分校,美国爱丁堡 北京大学 王东 北京大学 赵冬岩 文章链接 文章正文: 分支距离的概念: 下界的提出: ...

CaptureItTechnology的博客 1130

xiongyalisuanfa_任务分配算法_任务分配_多项式时间_匈牙利算法_

匈牙利算法是一种在多项式时间内求解任务分配问题的组合优化算法,并推动了后来的原始对偶方法。

上一篇: An Exact Graph Edit Distance Algorithm for Solving Pattern Recognition Problems
下一篇: When Operations Research meets Structual Pattern Recognition 2019
RunningBComeOn
博客等级 码龄10年 133粉丝 161原创
评论
成就一亿技术人!
拼手气红包6.0元
还能输入1000个字符
 
 条评论被折叠 查看
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付:10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

RunningBComeOn

你的鼓励是我最大的动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值