【文献速递】超级增强子驱动的lncRNA通过招募KDM4B加剧糖脂代谢和糖尿病心肌病

Ma等人于2024年在Molecular Metabolism上的发表一篇研究论文，题目为“Super-enhancer-driven LncRNA PPARa-seRNA exacerbates glucolipid metabolism and diabetic cardiomyopathy via recruiting KDM4B”。该项研究中主要通过RNA pull-down、染色质免疫沉淀、染色质分离、基因编辑等技术，探讨PPARa-seRNA的作用机制。

糖尿病心肌病（DbCM）是由于代谢紊乱引起的心脏功能障碍，表现为心脏能量利用减少和代谢底物从葡萄糖向脂肪酸的转变。这种代谢紊乱导致糖脂毒性，引发炎症和氧化应激，进而损害心脏功能。seRNA 指的是超级增强子相关 RNA（super-enhancer-related RNA），超级增强子（super-enhancer, SE）是一类富含增强子的基因组元件，能够调控关键基因的表达，seRNA是由这些超级增强子区域转录而来的RNA，主要为长链非编码RNA（lncRNA）。

首先通过ENCODE数据库中的ChIP-seq数据，筛选出在肝脏、肠道、胰腺、脂肪、心脏组织中与代谢相关的超级增强子及其相关seRNA。然后使用双荧光素酶报告基因检测PPARa-seRNA对转录的影响，通过CRISPR/dCas9系统验证了PPARa-seRNA的E1区域对PPARa-seRNA活性的影响；再通过RNA pull-down实验验证了KDM4B与PPARa-seRNA的结合关系，从而说明PPARa-seRNA通过与组蛋白去甲基化酶KDM4B相互作用，减少PPARa启动子区域的H3K9me3水平，从而