27、单细胞多组学：解析癌症奥秘

单细胞多组学：解析癌症奥秘

1. 单细胞转录组学

单细胞基因组学能够识别肿瘤不同亚克隆中的详细突变图谱。而单细胞转录组学方法则可进一步研究这些具有不同遗传组成的细胞的表达谱。单细胞RNA测序为肿瘤异质性提供了前所未有的见解，揭示了细胞间差异、肿瘤微环境中的新细胞类型、可塑性和癌症干细胞等奥秘。

多项研究展示了单细胞RNA测序的重要价值：
- 脑胶质瘤研究 ：对从五个原发性胶质母细胞瘤中分离出的430个单细胞进行研究，揭示了遗传异质性。研究发现单个细胞内存在不同的胶质母细胞瘤亚型，表明肿瘤内异质性（ITH）的存在。同时分析还显示肿瘤包含混合细胞状态，如祖细胞状态和分化状态，且具有不同的转录程序，为动态转变提供了推断证据。
- 黑色素瘤研究 ：分析了19名黑色素瘤患者的4645个单细胞，对恶性和非恶性细胞（免疫、基质和内皮细胞）进行了分析。该研究发现了具有耐药特性的罕见亚群，对浸润性T细胞的单细胞基因表达分析揭示了区分耗竭T细胞和细胞毒性T细胞的潜在生物标志物，有助于为免疫检查点阻断疗法选择患者。
- 慢性髓系白血病研究 ：分析了约2000个慢性髓系白血病（CML）患者的单细胞，以表征人类CML样本从诊断到缓解和疾病进展过程中单个细胞亚群的不同分子特征。研究揭示了CML单细胞的异质性，并确定了即使经过长期治疗仍持续存在的亚组。

肿瘤微环境在原发性和转移性部位的肿瘤形成中都起着重要作用，它为癌细胞的进化和生长提供了有利环境。单细胞RNA测序可以通过剖析肿瘤内的恶性细胞、基质细胞和免疫细胞，来揭示肿瘤微环境。例如：
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