生物信息学:从基础到应用的全面解析
1. 生物信息学与计算生物学概述
生物信息学是利用软件对模型或方法进行大量数据测试以证明其正确性并验证,之后撰写相关论文的领域。当一种方法用于回答生物学问题时,其成功与否并不取决于所应用的计算方法或工具,而是新发现或答案是否真实、是否经过验证,以及证据是否达到生物学界的标准,这便是计算生物学的范畴。
如今,这两个领域的界限并不十分清晰。随着数据的增加和技术的进步,它们之间的界限变得有些模糊。尽管主要差异仍然存在,但它们的相似性也在不断增加,不同研究者对这两个领域差异的理解可能有所不同。
2. 计算生物学的子领域
2.1 计算生物建模
该领域通过构建计算机模型来解决生物学问题,利用模拟评估生物系统的复杂性。需要使用高度专业化的算法和可视化软件,通过观察系统在不同环境下的变化来测试其鲁棒性,允许多个用户研究大量生成的数据。
2.2 计算基因组学
研究细胞和生物体的基因组,例如人类基因组计划,目的是获取整个人类基因组的数据,使医生能够分析患者的基因组,为基于患者遗传模式的靶向和个性化药物开发打开大门。通过比较从同一祖先获得的各种核苷酸结构,利用序列同源性来比较基因组。该领域仍在发展中,研究人员正通过大型联合项目和各种计算统计方法来了解基因组的非编码区域。
2.3 计算神经科学
研究神经系统的特性和结构,通过分析大脑数据创建实际应用工具。使用大脑模型分析神经系统的不同方面,包括详细到细胞水平的真实大脑模型,但这类模型容易出错、实施成本高且需要大量计算能力;还有评估神经系统物理特性的简化大脑模型,其能比真实大脑模型更大程
生物信息学全解析与应用
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