Amber或Swiss model蛋白残基重新编号

最新推荐文章于 2025-09-14 13:40:58 发布
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#python

本文介绍如何通过AmberUtils库中的RelabelChains.py脚本，解决处理蛋白质结构后编号调整的问题，避免与文献不一致。脚本简化了Excel操作，减少Linux识别错误。

我们利用Amber 或者Swiss model 处理蛋白后，经常遇到蛋白残基编号从1开始的情况，为了与文献中提到的残基一致，我们需要用原来的编号。

本来用excel 处理下，结果发现报错，excel 中有太多的分隔符，可能在linux识别容易出 问题。
其实已经有人写了脚本，我们直接用就可以啦
https://github.com/williamdlees/AmberUtils

利用这个里的 RelabelChains.py
轻松搞定

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