xiaolan39的博客

origin copy page 到word 后 显示不全，修改方法Tools > Options > Page >margin,将选项改为page一般自己在Book中对不同的数据在 Comments 一项就会填好，这样图例自动跟新，Units 也会填好，这样可节省时间，自己也清楚数据。自己要做的图很多，所以要学会高效运用。1.利用模板origin 中自己设置字体为28，线宽为0.5-1.5，rmsd用的1.5，rmsf用的1.5，氢键数也用的0.5图例注释线宽用的0.5.

xmgrace 在linux下是自己常用的一款软件，这里写下跑完动力学RMSD后的作图。一张图上多条曲线，但没有命令行来指定数据集图例标题。那如何解决呢？可以使用一个参数文件template.par这个参数文件的内容为with g0s0 legend “title0”s1 legend “title1”s2 legend “title2”然后运行命令xmgrace -param template.par 1.xvg rmsd_amber_2.xvg rmsd_3.xvg 就可以在

pymol 选择对接的分子5A 范围内的氨基酸残基create pocket, byres 4dxd within 5 of resn 9pc (这条命令的目的就是以残基9pc为中心，在4dxd这个蛋白质里找出跟9pc距离在5 A的氨基酸，生成一个pocket， 9pc这个残基是4dxd这个蛋白质晶体中的一个配体）或者下面的命令select 5Alig, byres lig around 5show sticks, 5Alig选择残基100.102,108-111select res, resi