利用openbabel移除重复的分子

本文介绍了一种利用Babel工具来识别并去除两个文档中重复分子的方法。通过整合两个文档为一个,并应用Babel的独特功能,可以有效地找出并标记重复的分子。此过程对于化学研究和药物开发中的分子数据管理至关重要。

有时候要比较两个不同的文档中的分子,发现有无重复的分子,可以利用babel。

我们可以把两个文档整合为一个文档,利用babel 发现两个文档中的重复分子。
详细内容可参考:https://openbabel.org/docs/dev/Command-line_tools/babel.html#remove-duplicate-molecules

具体操作:
babel infile.xxx -onul --unique #这里xxx 为文件格式

发现重复的分子,输出为
Removed xxx1 - a duplicate of xxx2 (#1)
xxx1与xxx2相似,#1 为发现的第几个分子

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