在集群上运行alphafold预测蛋白质结构

背景：在本地运行alphafold是不可能的，因为数据库文件就3TB。
首先准备

服务器数据库地址：/share/database/alphafold_data/

只启动CPU的模式
bsub -J alphafold -n 10 -R span[hosts=1] -o %J.out -e %J.err -q normal “bash run_alphafold.sh -d /share/database/alphafold_data/ -o ~/alpha_out/ -f ~/alphaFOLD/TM_Ghir_D05G026370_protein.fasta -t 2020-05-14 -g False”
还没有完全探索成功。

bsub -J alphafold -n 10 -R span[hosts=1] -o %J.out -e %J.err -q normal “bash run_alphafold.sh -d /share/database/alphafold_data -o alphafold_out -f test.fa -t 2021-11-01 -n 20 -m monomer”