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RSS订阅原创 选择or扩散？群落构建应该如何研究？
群落构建是生态学中研究物种如何在特定环境中组合形成群落的过程，其核心机制包括选择（Selection） 和 扩散（Dispersion）。
2025-12-11 10:13:46
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原创 解离or抽核，单细胞测序到底怎么选？
随着测序的不断发展，单细胞转录组测序（Single-cell RNA sequencing，scRNA-seq）以其前所未有的分辨率在一众技术中脱颖而出，正深刻变革着我们对生命复杂性的认知。
2025-12-09 11:00:55
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原创 轻松拿捏顶刊：看T2T基因组如何破译人间美味大黄鱼的环境适应性密码
中国沿海大黄鱼可分为三大种群：闽粤东（MYD）、岱衢（DQ）和瑙州（NZ）。近期发表在《Advanced Science》上的文章，通过整合 PacBio HiFi、超长牛津纳米孔（ONT）和Hi-C 三大测序技术，首次成功构建了闽粤东群（MYD）和岱衢群（DQ）大黄鱼的两个端粒到端粒（T2T）无缺口基因组。对两个种群T2T基因组的深入研究发现：两个种群所有染色体两端存在“TTAGGG/CCCTAA”的重复序列，着丝粒由42 bp的Cen-42和168 bp的Cen-168构成复杂的高阶重复结构。
2025-12-08 10:47:40
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原创 如何解决eDNA采样难题？凌恩生物重磅推出一站式服务
凌恩 生物与武汉水生所联合，共同推出环境DNA（eDNA）一站式解决方案，旨在助力科研人员高效且精准地开展生态监测工作，从容应对各种复杂环境的采样挑战。凌恩所采用的旗舰设备——便携式环境DNA采集仪，是一款专门针对野外实际应用场景研发的智能化采样设备，可有效提升采样效率与数据可靠性。5. 专用自干燥过滤器：无需添加乙醇或冷冻保存，可自动脱水干燥处理，室温条件DNA可保存一个月，极大地简化流程并降低污染风险。3. 智能监控系统：可实时显示流速、水温、电导率等参数，支持定量采样，操作精准且便捷。
2025-12-05 10:16:41
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原创 凌恩生物HiC Meta强势回归！高深度解析复杂微生物群落/基因互作关系！
Hi-C Meta测序分析是一种融合Hi-C技术与宏基因组测序的方法。
2025-12-03 20:10:16
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原创 单细胞转录组测序，哪个才是你的菜？！
单细胞（核）转录组：采用分子标签（barcode）的单细胞识别、利用液滴微流控技术，在液滴生成时稳定实现细胞分离，可获得微球、试剂、细胞的共包裹体，达到较高的细胞捕获率，从而获得每个细胞的表达谱信息。* 人肠道单细菌转录组测序： 针对微生物物种组成复杂的粪便样本，检测不同微生物单菌株的表达谱特征，可用于肠道微生物组的功能及表型异质性研究，有助于提升肠道微生物组分析的精准度、深入细菌间及细菌与宿主间的互作研究，并可进行细菌-噬菌体精准的关联分析。适用于样本量极低微的单细胞克隆样本。
2025-12-02 11:38:14
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原创 顶刊思维——三代宏基因组最新文献速览
三代测序技术（Third-Generation Sequencing, TGS）以单分子长读长为核心特征，突破了二代测序（NGS）短读长的固有限制，结合高准确性（如PacBio HiFi）或超长实时测序（如Oxford Nanopore）的特性，推动了宏基因组学从“碎片化组装”向“完整基因组解析”的跨越。本研究为深入探究肠道微生物组，基于一项在马维拉开展的儿童生长纵向临床试验（纳入队列中8名儿童，进行为期11个月的纵向采样，共收集47份样本），采用三代长读长宏基因组技术开展了系统研究。
2025-12-01 17:48:15
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原创 重要功能基因丰度低？凌恩生物reads层面元素循环研究新方案上线！
一次获得16S、Cell、ppm、rpkm、tpm五大丰度定量单位，超100项分析内容，涵盖物种群落多样性分析、群落构建机制、元素循环功能基因注释、指示物种分析，更有相关性回归、网络图、循环路径图等热门分析！助力精准识别元素循环中的关键功能基因。在物种群落模块，按细菌、古菌、病毒分析，获得三个物种的多样性分析结果，性价比超高！此次分析更新之后，不仅可以让老师获得古菌、细菌、病毒三种物种的群落组成、机制、元素循环、功能基因、宿主分析等更多样化、全面的分析内容，更为各位老师的文章增加亮点，可谓一举两得。
2025-11-26 10:15:09
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原创 凌恩 生物T2T和单倍型基因组频发！再创佳绩！
本研究不仅展示了高粱基因组的完整图谱，还揭示了其独特的遗传特征和潜在的育种价值。）为研究对象，基于新组装的染色体水平基因组、转录组、全基因组重测序数据和生理表型数据，首次系统分析了其系统发育模式、热敏感性和遗传分化，并在同时考虑生理和遗传性状的情况下预测其未来的分布变化，构建起从生理遗传到模型预测的分析体系。本研究提出了一种基于个体间单核苷酸多态性（SNP）基因型标准化杂合度的方差分析（ViSHet），通过计算基因组区域（本研究中为500个SNP）来识别大而分化的单倍型区块区域（LHBRs）的方法。
2025-11-25 10:54:48
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原创 凌恩生物单细胞平台有新成员啦——10x Chromium iX正式入驻！
单细胞组学技术正加速生命科学领域的突破探索，为精准解析生物机制提供核心工具。
2025-11-24 17:34:16
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原创 国际趋势——高 性价 比探索生物多样性
全球越来越多的组织倡导对野外采集的样本采用GS/MGS。GS/MGS技术已经解码高山植物的演化密码、揭开更新世时期格陵兰岛植被和气候变迁的神秘面纱，澳大利亚国家科学机构已经启动项目，计划在2030年前利用GS技术构建全国性的生物多样性DNA数据库。基于以上研究方法的局限性，越来越多的研究者开始聚焦低数据量测序——基因组浅层测序（GS）/宏基因组浅层测序（MGS），近日，一篇发表在Molecular Ecology Resources（Q1）的文章，详细介绍了浅层测序的优势、应用场景、展望。
2025-11-20 10:46:02
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原创 一区14+，非模式物种的单细胞研究范例来了！
驴作为重要的牲畜资源，其皮、肉、奶等产品在药用与食用领域具有广泛应用，驴皮阿胶的应用历史源远流长，是中医治疗血虚的首选药物。
2025-11-17 10:59:32
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原创 Plant Communications| 泛基因组数据库KPGD为猕猴桃育种提供“基因蓝图”
作为中国原生的重要果树，猕猴桃属（Actinidia）包含54个物种、21个亚种共75个类群，兼具经济价值与科研意义。
2025-11-14 11:22:08
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原创 NEE | 热点！宏基因组eDNA快速评估生物遗传多样性
生物多样性及其相关的遗传多样性正在以前所未有的速度丧失，因此需要采取新方法来捕捉和记录遗传多样性，防止其消失。
2025-11-11 09:22:21
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原创 前沿快报-泛基因组：推动生物进化与改良研究
组装，对248份野生马铃薯、地方品种和现代栽培品种进行重测序，并构建基于图的泛基因组，同时利用LC-MS/MS对157份材料的块茎进行代谢组分析。还明确了SVs对基因表达的影响，以及生长素相关基因的扩张与匍匐茎发育的关系，并开发了马铃薯泛基因组数据库（PPDB）。通过构建首个枣树泛基因组，鉴定核心与可变基因，揭示驯化过程中基因组变异及人工选择的关键基因。），我们对泛基因组的基础概念和实际应用已十分了解，从挖掘新基因到解析植物的适应性进化，如番茄的超级泛基因组、大豆的泛基因组、杨树泛基因组……
2025-11-07 11:13:35
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原创 干货！如何进行“转录组+”医学研究
在医学研究中，单一组学（如基因组、转录组、蛋白组或代谢组）仅能反映生物整个复杂系统的局部特征，而疾病的发病机制往往涉及多层次的分子互作网络。
2025-11-06 14:05:09
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原创 重磅更新！三代宏基因组Binning新策略，组装效率飙10倍！
三代测序技术（如Oxford Nanopore，简称ONT）凭借超长读长、无需PCR扩增及实时测序等核心优势，可直接对复杂环境样本中的微生物全DNA进行高通量测序，实现从物种水平到功能层面的全面解析。
2025-11-04 14:06:08
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原创 凌恩又升级内容啦！160+项分析！
在系统发育零模型（计算βNTI）的基础上，增加了分类单元零模型（计算RCbray），分析内容包括RCbary/βNTI计算、βNTI比较分析、生态过程分析、生态过程分组分析、相关性分析等6项，助力区分确定性与随机过程对群落构建的贡献。本次凌恩 关于多营养级扩增子项目升级构建了“十二大核心模块，160余项精细分析”的研究体系，在多样性、多营养级群落构建机制、生态位分析等多个方面进行了升级，并新增了多项分析内容，如网络分析，从基础数据解析到深层机制挖掘，实现全流程覆盖。今天的主角是多营养级扩增子。
2025-11-03 17:46:13
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原创 ADVANCED SCIENCE | eDNA技术助力破解微生物群落演替维系鱼类多样性
凌恩 优势项目eDNA metabarcoding技术，可非破坏性的深入生态全境研究。
2025-10-29 11:10:04
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原创 收藏！10+版转录因子调控机制研究，“测序 + 实验” 全套方案在这
转录因子作为植物基因表达的关键调控者，在生长发育、逆境响应（如抗病、抗逆）、代谢调控等一系列核心生物学过程中扮演着不可替代的角色。
2025-10-28 11:43:12
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