alphaFOLD3批量上传互作预测序列所需JSON文件的准备

背景

有过预测与启动子序列互作的转录因子的想法，最近alphafold3发布，便试图使用alphaflod3看看能不能进行初步筛选。
大批量预测需要提交许多序列，在网页端一个个粘贴不现实，于是alphafold sever提供了JSON文件上传接口。
不过，alphafold sever虽然提供了利用JSON文件批量上传job的接口，但是却限制每天能执行的job数量为20个，在前几天还只是10个。
alphafold sever网站：https://golgi.sandbox.google.com/

提供一个JSON文件创建脚本

alphafold团队在github上提供了json文件的模板，我也只是对着抄一下，把代码贴出来能给像我这样的小白用户节约几个小时的时间。
目标：创建一个JSON文件，功能是创建n个jobs，分别预测每一个转录因子与目标启动子序列的互作。
1 准备目标物种的转录因子数据集
从Plant Transcription Factor Database网站下载，链接为：https://planttfdb.gao-lab.org/，棉花中有5000个转录因子。如何查找，请参考其他教程。
2 获得差异表达基因的启动子序列
3 使用python创建JSON文件

import json  
# 1把fasta文件拆分成为字典并储存在列表中
sequences_data = []
current_id = None
for line in open('/mnt/d/bioinfor/database/陆地棉转录因子/Ghi_pep_51.txt', 'r'):
    if line.startswith('>'): 
        if current_id is not None:  
            # 把cur